卵巢浆液性囊腺癌化疗耐药和敏感组织中的miRNA差异表达谱检测及生物信息学分析

发布时间：2017-06-05 20:13

  本文关键词：卵巢浆液性囊腺癌化疗耐药和敏感组织中的miRNA差异表达谱检测及生物信息学分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:寻找卵巢浆液性囊腺癌化疗耐药及敏感组织中micro RNA的差异表达,并利用生物信息学技术对差异表达的micro RNAs进行生物信息学分析,为研究上皮性卵巢癌化疗耐药产生的分子机制及逆转其化疗耐药提供理论基础和依据。方法:首先,应用micro RNA表达谱基因芯片寻找卵巢浆液性囊腺癌化疗耐药及敏感组织中差异表达的micro RNAs;其次,选取部分差异表达的micro RNAs应用RT-PCR实验技术在扩大的组织样本中进行验证;最后,运用生物信息学软件对符合要求的micro RNAs进行相关生物信息学分析。结果:1、在micro RNA表达谱基因芯片中筛选出与卵巢浆液性囊腺癌化疗耐药相关的表达上调miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p,表达下调miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p。2、表达差异miR-27a-3p,miR-93-3p,miR-141-3p,miR-200b-3p,miR-497-5p,miR-675-3p在扩大样本组织中的RT-PCR验证结果与micro RNA微阵列芯片结果相一致。3、上调micro RNA(miR-27a-3p、miR-141-3p、miR-200b-3p)通过靶基因预测软件预测到GRB2、NLK、APC、ABL2、ZEB2、RNF2等307个靶基因,下调micro RNA(miR-93-3p、miR-497-5p、miR-675-3p)通过靶基因预测软件预测到ALS2、KLF8、CCND2、IGF1R、ZFX、CALU等53个靶基因。4、上调micro RNAs预测的靶基因GO(BP模块)分析结果显示:正调控含核酸碱基化合物代谢过程、正调控高分子代谢过程及细胞死亡可能与化疗耐药及药物代谢存在相关性。上调micro RNAs预测的靶基因KEGG Pathway分析结果显示:MAPK信号通路、ErbB信号通路及TGF-β信号通路可能参与了化疗耐药产生的机制。5、SP1、TGFB2、PAK2基因蛋白均参与了与耐药相关的生物过程和信号通路。结论:1、miRNA芯片微阵列分析及生物信息学分析技术可为人类研究上皮性卵巢癌多药耐药机制提供新的途径,micro RNAs与上皮性卵巢癌化疗多药耐药间的相关性将为逆转其多药耐药提供一种全新的思路和策略。2、miRNA-27-3p及其靶基因SP1,miRNA-141-3p及其靶基因TGFB2,miRNA-200b-3p及其靶基因PAK2可能在上皮性卵巢癌化疗耐药的发生机制中扮演重要角色。
【关键词】：miRNA表达谱基因芯片 卵巢浆液性癌 化疗耐药及敏感 生物信息学技术
【学位授予单位】：山西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R737.31
【目录】：

• 中文摘要5-7
• 英文摘要7-9
• 缩略简称9-10
• 前言10-11
• 1 材料与方法11-18
• 1.1 实验材料11
• 1.2 实验仪器及设备11-12
• 1.3 实验试剂12
• 1.4 实验方法12-18
• 1.4.1 microRNA表达谱基因芯片检测12-14
• 1.4.2 实时荧光定量PCR验证芯片差异表达谱14-17
• 1.4.3 micro RNA差异表达谱的靶基因预测17
• 1.4.4 DAVID软件平台对靶基因行生物信息学分析17-18
• 2 结果18-26
• 3 讨论26-29
• 4 结论29-30
• 参考文献30-33
• 文献综述33-42
• 参考文献38-42
• 在学期间发表的学术论文与研究成果42-43
• 附录43-45
• 致谢45-46
• 个人简历46

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