宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析

发布时间：2017-06-20 19:17

  本文关键词：宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因。方法应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edge R软件分析该数据集中MTA1高表达组与低表达组的全转录组差异表达基因,应用DAVID平台对这些差异表达基因进行聚类分析,应用STRING在线平台和Cytospace软件对这些基因进行互作网络分析,筛选关键的网络节点基因。结果TCGA-CESC宫颈癌数据库中MTA1表达水平与肿瘤临床转移和病理分级呈显著正相关(P0.01),在不同MTA1表达水平的宫颈癌转录组中存在显著且较一致的差异表达基因集,这些基因主要聚集在癌症通路、干细胞通路、细胞转移、细胞分化等方面,与肿瘤的恶性生物学行为显著相关。基因筛选显示,宫颈癌中与MTA1协同表达的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差异表达基因集中最重要的节点基因,这些基因聚集在GPCR相关通路。结论 MTA1高表达与宫颈癌转移显著相关,且与肿瘤细胞的干细胞通路、趋化因子受体通路、细胞转移、细胞分化等基因调控网络活化相关。MTA1的协同表达基因网络中的节点基因可能参与了宫颈癌的转移调控,并最有可能成为宫颈癌治疗的分子靶点。
【作者单位】： 唐山市开滦总医院妇产科;中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室;首都医科大学附属北京妇产医院妇科微创中心;
【关键词】： 转移相关基因 宫颈肿瘤 计算机生物学
【基金】：国家自然科学基金(81572842,81372159) 北京市自然科学基金(7132071) 北京市卫生系统高层次卫生技术人才学科骨干项目(2015-3-090)~~
【分类号】：R737.33
【正文快照】： 宫颈癌的发病率在世界范围内居女性恶性肿n i h.go v/tc ga/tc ga Ca n c e r D e t a i l s.j s p?d i s ea s e Ty p e=瘤的第三位,仅次于乳腺癌和结直肠癌,每年约有C E S Cd i s e a s e Na m e=C e r v i c a l%2 0 s q u a m o u s%2 050万新发病例及半数死亡病例[1-3]

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