基于微阵列数据探讨金属硫蛋白在吸烟者气道的变化及其可能机制
发布时间:2024-07-02 20:38
目的探讨吸烟对气道金属硫蛋白(MT)表达的影响及其可能机制。方法获取公共基因表达综合数据库(GEO)的微阵列矩阵数据并进行整合分析,以确定烟雾暴露后MT表达的变化趋势;同时使用mi RDB数据库预测靶向16个MT的mi RNA,CLUSTAL W软件对MT m RNA进行多序列比对。结果急性吸烟刺激气道MT表达,慢性吸烟抑制气道MT表达。慢性吸烟者气道MT1、MT2、MT3表达与吸烟指数呈显著负相关,但其不影响MT4表达。MT1、MT2、MT3 m RNA序列包含"CTCCTGC"片段,可与hsa-mi R-4722-5p种子区域匹配,而MT4 m RNA序列缺乏结合位点。结论 MT1、MT2、MT3和hsa-mi R-4722-5p可能是减轻吸烟损伤和预防慢性阻塞性肺疾病(COPD)进展的潜在靶点。
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 资料和方法
1.1 矩阵GSE97010和GSE14383数据处理[9]
1.2 整合分析
1.2.1 获取和筛选微阵列数据
1.2.2 探针过滤和基因映射
1.2.3 组内相关系数(ICC)
1.2.4 统计分析
1.3 建立线性回归模型
1.4 miRNA预测[10-11]
2 结果
2.1 急性烟雾暴露和CSC对MT的影响
2.2 长期烟雾暴露对气道MT1、MT2和MT3表达的影响
2.3 吸烟指数对气道MT1、MT2和MT3的影响
2.4 hsa-miR-4722-5p对长期烟雾暴露气道MT1、MT2、MT3的影响
3 讨论
本文编号:3999978
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 资料和方法
1.1 矩阵GSE97010和GSE14383数据处理[9]
1.2 整合分析
1.2.1 获取和筛选微阵列数据
1.2.2 探针过滤和基因映射
1.2.3 组内相关系数(ICC)
1.2.4 统计分析
1.3 建立线性回归模型
1.4 miRNA预测[10-11]
2 结果
2.1 急性烟雾暴露和CSC对MT的影响
2.2 长期烟雾暴露对气道MT1、MT2和MT3表达的影响
2.3 吸烟指数对气道MT1、MT2和MT3的影响
2.4 hsa-miR-4722-5p对长期烟雾暴露气道MT1、MT2、MT3的影响
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