棉鼠肺表面活性相关蛋白A基因生物信息学分析及其与肺损伤相关性

发布时间：2017-09-04 14:10

  本文关键词：棉鼠肺表面活性相关蛋白A基因生物信息学分析及其与肺损伤相关性

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【摘要】：目的分析棉鼠肺表面活性相关蛋白A(SP-A)的基因序列结构和生物信息学特点,观察棉鼠肺损伤模型中SP-A mRNA和蛋白的表达水平,初探SP-A表达规律与肺损伤的相关性。方法将32只棉鼠随机均分为4组:3个实验组棉鼠分别腹腔注射2mg/kg脂多糖(LPS)处理24、48和96h,对照组腹腔注射等量生理盐水。建模后提取棉鼠肺组织总RNA,经RT-PCR扩增SP-A基因,并对其进行生物信息学分析;组织切片观察LPS作用不同时期肺组织病理学变化;qRT-PCR分析SP-A mRNA的表达水平;蛋白质印迹法检测SP-A蛋白表达。结果棉鼠SP-A基因编码区长744bp,编码248个氨基酸,具有多个半胱氨酸保守位点、α螺旋结构和糖基化位点,与其他物种相比其核苷酸(75.4%~90.1%)和氨基酸(70.6%~87.1%)序列均具有较高的同源性。在LPS诱导肺损伤模型中发现,与对照组相比,实验组棉鼠肺组织病理学改变随LPS刺激时间延长而加重,具有时间依赖性;SP-A mRNA和蛋白的表达水平在LPS处理24h后开始迅速增加,差异有统计学意义(P0.001和P0.01),48h时仍持续上升(P0.001和P0.01),96h时略有下降,但仍保持在较高水平,与对照组相比差异有统计学意义(P0.05和P0.01)。结论棉鼠SP-A基因具有高度保守性;棉鼠SP-A mRNA和蛋白的表达水平与肺损伤严重程度密切相关,可反应肺损伤的不同时程。
【作者单位】： 重庆医科大学附属儿童医院儿科研究所儿童发育疾病研究教育部重点实验室儿童发育重大疾病诊治与预防国际科技合作基地儿科学重庆市重点实验室;
【关键词】： 棉鼠亚科 肺表面活性物质相关蛋白质A 肺损伤 计算生物学
【基金】：国家自然科学基金(81302523) 重庆市科委基础与前沿研究计划项目(cstc2016jcyjA0387,cstc2016jcyjA0007)~~
【分类号】：R563
【正文快照】： increased in three LPS groups,with rapid increase starting from 24hafter treatment(P0.001,P0.01),with continuousincrease at 48h(P0.001and P0.01),and slight decrease and still keeping at a high level at 96h(P0.05,P0.01).Conclusion SP-A gene of cotto，

本文编号：791973