巴曲酶的线性和构象型B细胞抗原表位的预测

发布时间：2017-11-07 22:40

  本文关键词：巴曲酶的线性和构象型B细胞抗原表位的预测

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【摘要】：目的:预测巴曲酶的B细胞线性表位和构象型表位,本项目的预期成果可为该药物的安全化应用提供新思路。方法:基于巴曲酶的蛋白质序列,采用DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS、BcePred和BepiPred 1.0服务器预测巴曲酶的线性表位。以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板,利用MODELLER9.10软件中的Pythonwin程序进行该酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行合理化评价。根据巴曲酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测构象型抗原表位。结果:得到肽端AA3~9、19~31、57~82、93~101、106~114、127~142、171~183、196~208、223~230区域为巴曲酶的B细胞线性表位优势区域。然后得到蛋白的N端41~48、57~71、76~82、93~100、109~115、127~133、146~152、194~203区段为B细胞构象型表位区域。结论:这些B细胞抗原表位可为降低巴曲酶的免疫原性提供实验依据。
【作者单位】： 大连理工大学生命科学与技术学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(81102378) 中央高校基本科研业务费专项资金资助(DUT11SM02)
【分类号】：R392
【正文快照】： 1963年Klobusitzi和Konig从美洲矛头蝮蛇(Bothrops atrox moojenii)毒液中分离得到一种丝氨酸蛋白水解酶,即巴曲酶(Batroxobin,EC 3.4.21.29)。该酶的基因已经被克隆,并在毕赤酵母系统里进行了重组表达,其部分生化性质也得到研究[1,2]。它能特异性裂解纤维蛋白原α链中Arg16-G

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 黄艳新;鲍永利;李玉新;;抗原表位预测的免疫信息学方法研究进展[J];中国免疫学杂志;2008年09期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 周涛;贾怀杰;何小兵;管齐赛;景志忠;;CD4~+T细胞表位分析鉴定技术研究进展[J];免疫学杂志;2013年06期

2 梁瑾;王靖飞;;B细胞表位预测方法研究进展[J];生命科学;2009年02期

3 欧阳玉梅;;构象性B细胞表位预测的免疫信息学方法及其网络资源[J];生命科学;2010年09期

4 朱盼;陈红兵;胡纯秋;李欣;罗春萍;;基于表位预测的花生过敏原Ara h6免疫交叉反应性研究[J];食品科学;2010年17期

5 郭春艳;赵向绒;胡军;;B细胞抗原表位的研究进展及其应用[J];生物技术通讯;2013年02期

6 钱春艳;宋丽君;余传信;殷旭仁;王s，

本文编号：1154453