我国不同基因型水痘-带状疱疹病毒流行毒株gE基因序列分析

发布时间：2017-11-10 00:25

  本文关键词：我国不同基因型水痘-带状疱疹病毒流行毒株gE基因序列分析

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【摘要】：为进一步了解我国不同地区流行的水痘—带状疱疹病毒(VZV)病毒株的基因型分布和分析代表性病毒株gE基因序列。于2010年12月至2011年6月期间,收集来自北京市、长春市、拉萨市和乌鲁木齐市4个地区水痘和带状疱疹患者的疱疹液拭子和皮肤痂片,共计18份。用单个核苷酸多态性(SNP)谱的方法确定病毒株的基因型。然后采用聚合酶链反应(PCR)方法扩增gE基因的全长片段,并进行测序分析。SNP分析显示18个病毒株的基因型共为4种,其中有7株属于clade2遗传支,1株属于clade3遗传支,4株为clade5遗传支。另有6株病毒兼有不同遗传支的特征,按照目前国际通用的分型方法不能归属于任何明确的遗传支。对不同病毒株gE基因序列分析,除了发现3个国外已有报道的1个同义突变(T660C)和2个反义突变(C119T、C1606A),还发现了3个新的反义突变(C56T、C1109T和C917A)和4个同义突变(C54T、T1075C、T816C和G279A)。首次在我国新疆自治区发现了clade5遗传支的VZV,在长春市还发现了目前尚未能分型的6株病毒。对部分病毒株gE基因序列分析,在gE的e1和c1抗原表位的编码区内中检出1个新型反义突变(C917A),需要进一步研究该突变对该病毒免疫原性和致病性的影响。
【作者单位】： 安徽医科大学微生物学教研室;吉林大学白求恩第一医院皮肤科;新疆维吾尔自治区人民医院皮肤科;北京大学附属第三医院皮肤科;西藏大学医学院基础部;哥伦比亚大学病理与细胞生物学教研室;
【基金】：国家自然科学基金(30872253) 安徽省科技厅科技攻关项目(8010302179)
【分类号】：R373.1
【正文快照】： 水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)属疱疹病毒α亚科,为双链DNA病毒。VZV能引起两种临床表现截然不同的疾病,原发感染引起水痘,并可潜伏在感染者的背根神经节、颜面神经节、肠道神经节等多处感觉神经节中,日后在机体免疫功能下降时(分子机理尚不清楚)病毒发生再

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