东莞地区诺如病毒ORF2基因克隆与进化树分析

发布时间：2017-11-10 01:17

  本文关键词：东莞地区诺如病毒ORF2基因克隆与进化树分析

  更多相关文章： 诺如病毒 P区 序列分析 b病毒株

【摘要】：目的探讨东莞地区婴幼儿感染的诺如病毒ORF2基因序列特性,分析东莞地区诺如病毒的基因型。方法收集2004年和2009年东莞地区婴幼儿腹泻标本66份,参考诺如病毒Farmington Hills株(AY502023)基因组序列,自行设计了引物两段扩增ORF2基因的引物,短片段作为检测标本的片段,分段扩增病毒ORF2全长基因,PCR产物克隆于T载体上,序列测定,用ClustalW/X和MEGA5.0等软件进行序列特性分析和基因型分析。结果获得了3株ORF2全长基因,全长为1623bp,ORF2编码主要结构蛋白衣壳蛋白(VP1),VP1蛋白有两个主要区域:P区(protruding)和S区(shell);将病毒株NVdgsl0902、NVdgsl0910的P2区与诺如病毒GⅡ-4基因型中a、b、c、d、e、f 6个亚型的P2区氨苷酸序列进行同源性比较,同源性为86.0%～91.0%,而与2006b新变株为97.0%,病毒株NVdgsl0412的P2区与诺如病毒GⅡ-4基因型中a、b、c、d、f5个亚型的P2区氨苷酸序列进行同源性比较,同源性为88.0%～93.0%,与e亚型的同源性为98.1%。结论 NVdgsl0412属于GⅡ-4e型,NVdgsl0902、NVdgsl0910属于GⅡ-4f亚型的2006b新变异株,2004年与2009年东莞地区的诺如病毒流行株发生了变异,目前是以2006b新变异株作为主要的流行株。
【作者单位】： 东莞市儿科研究所分子生物研究室;
【分类号】：R373
【正文快照】： 腹泻是全世界范围内婴幼儿最常见的疾病之一,诺如病毒(Norovirus)是引起婴幼儿急性腹泻的重要病原体。诺如病毒属于杯状病毒科,基因组全长约为7.7kb,整个基因组有3个编码框为ORF1、ORF2和ORF3,诺如病毒现分为5个基因组(Genogroups)[1],其中GⅠ、GⅡ是引起人急性胃肠炎两个最

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 田春梅;李洁;吴安华;;诺如病毒——挑战感染控制[J];中国感染控制杂志;2008年05期

2 张贤群;;动物诺如病毒[J];国外畜牧学(猪与禽);2009年06期

3 田甜;董英;薛强;邹明强;王伟;;诺如病毒RT-PCR-反向斑点杂交检测方法的建立[J];生物技术通报;2010年03期

4 杜雄伟;李叶;肇惠君;;诺如病毒聚合酶基因的扩增及其遗传变异研究[J];中国病原生物学杂志;2011年10期

5 郭丽;周红莉;屈建国;王健伟;徐樨巍;洪涛;;人诺如病毒衣壳蛋白的密码子优化及在昆虫细胞中的表达[J];中国病毒学(英文版);2006年02期

6 靳淼;樊景凤;于天飞;方肇寅;王君伟;;诺如病毒CHN02/LZ35666株RdRp和VP1基因序列分析[J];病毒学报;2007年01期

7 曾玫;王晓红;朱启昒;;诺如病毒及其受体人类组织血型抗原的研究进展[J];临床儿科杂志;2007年12期

8 赵玉然;薛长湖;王静凤;唐庆娟;杨文鸽;梁君妮;李丹;;诺如病毒基因原核表达的研究[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2007年S2期

9 邓丽丽;刘巍;谭冬梅;杨进业;龚健;林枚;谢镇国;杨哲;;广西壮族自治区首次检出的GⅡ.4型诺如病毒N/S区基因特征[J];中国疫苗和免疫;2008年03期

10 李雅静;林祥梅;吴绍强;刘建;梅琳;;一株诺如病毒的3’RACE扩增及基因序列分析[J];中国畜牧兽医;2008年08期

中国重要会议论文全文数据库 前2条

1 刘建;李雅静;吴绍强;林祥梅;梅琳;韩雪清;贾广乐;;一株诺如病毒的3′RACE扩增及基因序列分析[A];第二届全国人畜共患病学术研讨会论文集[C];2008年

2 薛亮;吴清平;;诺如病毒分子进化研究进展[A];2010第二届中国食品安全高峰论坛论文集[C];2010年

中国硕士学位论文全文数据库 前2条

1 张晓红;北京地区成人腹泻诺如病毒的流行和分子特征的初步研究[D];中国疾病预防控制中心;2009年

2 肖建鹏;湘琼两地蝙蝠携带星状病毒与诺如病毒的调查研究[D];南方医科大学;2011年

，

本文编号：1164431