生物信息学辅助克隆和分析人GLUT-9基因启动子

发布时间：2017-12-03 14:25

  本文关键词：生物信息学辅助克隆和分析人GLUT-9基因启动子

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【摘要】：目的:对人GLUT-9基因5′-非翻译区进行克隆,并对其启动子和转录调控区进行生物信息学分析,为后续的GLUT-9基因的转录调控研究奠定基础。方法:通过搜索网络数据库,得到GLUT-9基因翻译起始点上游约2 kb的序列。以人总DNA为模板,采用PCR方法进行序列克隆。运用BDGP:Neural Network Promoter Prediction软件对上述序列进行分析,预测出该段序列可能的启动子区域;运用TFSEARCH软件分析潜在的转录因子结合位点。结果:人GLUT-9基因的启动子可能位于转录起始点上游反义链的-550到-503区,序列上存在包括CdxA、SRY和Lyf-1等12个转录因子的潜在结合位点。结论:克隆得到人GLUT-9基因5′-非翻译区2 kb的序列,对人GLUT-9基因启动子和5′-非翻译区调控区序列进行了初步的生物信息学分析,为后续试验提供了研究基础。
【作者单位】： 南方医科大学南方医院神经内科;
【基金】：广东省科技计划项目(编号:2011B061300004) 广东省自然科学基金(编号:S2011010002975)
【分类号】：R346
【正文快照】： 葡萄糖转运蛋白-9(facilitated glucose trans-porter 9,GLUT-9)基因位于4p15.3-p16,全长214 025 bp,含1个非编码区外显子和13个编码区外显子,编码葡萄糖转运体9(glucose transporter9,GLUT9)[1]。对多个国家的白种人群运用基因芯片进行全基因组扫描分析发现GLUT-9基因的遗传

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1 何文s，

本文编号：1248940