人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析

发布时间：2017-12-09 23:01

  本文关键词：人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析

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【摘要】：精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系.根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE数据库预测人LDH-C4的功能基序;利用Clustalw2、TreeView1.6.6进行LDH-C4进化树的构建;利用I-TASSER软件预测人LDH-C4的二、三、四级结构以及功能位点.结果表明:在190!196位有1个LDH活性位点,该位点为脊椎动物各亚型乳酸脱氢酶共有的催化位点,为进化中的1个保守序列;从进化树来看,LDHC和LDHB的亲缘关系比较近;人LDH-C4与小鼠LDH-C4的二级、三级结构具有很高的相似性;LDH-C4属乳酸脱氢酶-苹果酸脱氢酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-1(cd05293)家族的成员,属于NAD依赖性酶,拥有LDH-1家族具备的基本结构特点.以上结果为研究LDH-C4基因突变对其功能的影响打下基础.
【作者单位】： 南京军区福州总医院全军计划生育优生优育研究所;
【基金】：国家自然科学基金(No.81170562) 福建省自然科学基金(No.26111058)~~
【分类号】：R321.1
【正文快照】： 乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)以NAD+为辅酶,催化乳酸与丙酮酸的互相转化,由4个亚基组成,广泛分布于脊椎动物、植物和细菌.脊椎动物组成LDH有3种不同类型:LDH-A、LDH-B、LDH-C.由4个A亚基组成的LDH-A4主要存在于骨骼肌(故LDH-A4又称LDH-M4),最适合于在无氧条件下催

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 李博;张朵;曾健;富显果;柯龙凤;颜水堤;严爱贞;兰风华;;不明原因男性不育人群中睾丸特异性乳酸脱氢酶基因突变的发现及其意义[J];生物化学与生物物理进展;2010年04期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 颜水堤;张朵;曾健;富显果;柯龙凤;兰风华;;截短的人精子特异性乳酸脱氢酶L178X突变体丧失催化活性[J];中国生物化学与分子生物学报;2010年07期

中国硕士学位论文全文数据库 前2条

1 王竹伟;能蛋水平对北京油鸡后期繁殖性能的影响及睾丸基因表达谱的建立[D];甘肃农业大学;2011年

2 颜水堤;人乳酸脱氢酶C4结构的生物信息学研究及其L178X突变体表达载体的构建[D];福建医科大学;2010年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 王铁霞，，陈庆林，郭玉佳;试管悬浮孵育法检测人精子LDH－X活性[J];湖南医科大学学报;1996年04期

2 ;Construction of sperm-specific lactate dehydrogenase DNA vaccine and experimental study of its immuno-contraceptive effect on mice[J];Science in China(Series C:Life Sciences);2008年04期

3 辛娜;张朵;陈平;涂向东;吴玉水;兰风华;;人精子特异性乳酸脱氢酶DNA疫苗的构建及免疫效果的初步研究[J];细胞与分子免疫学杂志;2008年12期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 黄庆海,张儒祥;SARS病毒17株蛋白质序列的初步分析[J];东南大学学报(医学版);2003年04期

2 梁浩,王凤山,韩金祥,黄海南,刘毅,鲁艳芹;诊断性传播疾病寡核苷酸芯片的研制[J];山东大学学报(医学版);2004年01期

3 唐爱发;张振明;桂耀庭;蔡志明;;睾丸特异性启动子计算机识别方法研究[J];中国男科学杂志;2010年02期

4 胡仁明,彭永德,任双喜,顾彦杰,宋怀东,黄长晖,傅肃能,李月彬,黄秋花,张成康,顾健,俞亚萍,徐淑华,傅刚,陈名道,韩泽广,陈家伦;正常人肾上腺组织基因表达谱的研究[J];中华内分泌代谢杂志;2000年01期

5 陈勇;张朵;辛娜;熊永忠;陈平;李博;涂向东;兰风华;;精子特异性乳酸脱氢酶DNA疫苗的构建及免疫避孕效果的实验研究[J];中国科学(C辑:生命科学);2008年02期

6 伦永志;雷莎;成军;王毓婧;王琦;沈立婷;蒋海辉;张尧;;乙型肝炎病毒DNA聚合酶反式调节蛋白HBVDNAPTP1的亚细胞定位与结构预测[J];解放军医学杂志;2009年03期

7 李应涛;吴兴安;邱力军;;分泌型单链双功能抗体分子间接头的设计及软件分析[J];第四军医大学学报;2007年02期

8 卢学春;楼方定;朱宏丽;范辉;窦立萍;杨波;康慧媛;于力;;ID4基因表达谱的生物信息学分析[J];军医进修学院学报;2007年02期

9 辛娜;张朵;陈平;涂向东;吴玉水;兰风华;;人精子特异性乳酸脱氢酶DNA疫苗的构建及免疫效果的初步研究[J];细胞与分子免疫学杂志;2008年12期

10 黄玉;李薇;迟小华;刘丽宏;张峰;党艳辉;杨波;卢学春;;人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析[J];解放军医学杂志;2010年02期

中国重要会议论文全文数据库 前2条

1 黄庆海;张儒祥;张建琼;谢维;;应用位点特异性打分矩阵对MHC-PEPTIDE亲和力的预测[A];江苏省遗传学会第七届代表大会暨学术研讨会论文摘要汇编[C];2006年

2 韩启德;;基因组研究将深刻改变临床医学[A];中国优生优育协会第四届全国学术论文报告会暨基因科学高峰论坛论文专辑[C];2008年

中国重要报纸全文数据库 前3条

1 胡德荣;中德科学家联手分析蛋白质拓扑结构和功能[N];健康报;2006年

2 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年

3 记者 李天舒;汉族人群遗传结构研究取得进展[N];健康报;2009年

中国硕士学位论文全文数据库 前4条

1 辛娜;人精子特异性乳酸脱氢酶的原核表达、DNA疫苗的构建及其基因免疫效果的初步鉴定[D];福建医科大学;2005年

2 孙文斌;p12～（doc-1）蛋白抗原肽抗体制备及应用[D];第四军医大学;2004年

3 杨滨;HAb18G/CD147及其单抗的分子模建对接和抗体人源化设计的研究[D];第四军医大学;2007年

4 李阳;基于条件随机场的RNA二级结构预测算法[D];北京理工大学;2011年

本文编号：1272146