应用骨髓库HLA资料构建高匹配诱导多能干细胞库的可行性研究

发布时间：2018-07-17 20:17

【摘要】：目的研究利用骨髓库HLA资料建立高匹配诱导多能干细胞(iPS)库的可行性。方法通过对中华骨髓库湖南分库长沙实验室5 236(人)份HLA分型数据统计分析,找出O型HLA-A、-B、-DRB1三座位纯合子数据,计算以纯合子志愿者为假定iPS供者、5 236名随机志愿者为假定患者的匹配几率;同时计算随机志愿者HLA单体型频率,评估以O型HLA高频单体型纯合子志愿者为假设iPS供者的匹配几率。结果在5 236份骨髓供者资料中共发现O型HLA单体型纯合子14种,以此建库可以分别为49.81%(2 608/5 236)、61.29%(3 209/5 236)、79.51%(4 163/5 236)、75.76%(3 967/5 236)及97.78%(5 120/5 236)的假定患者提供5种匹配水平的iPS供者;共检出17种高频率(HF1%)的单体型,以这些单体型的O型纯合子建库可以分别为64.06%(3 354/5 236)、75.55%(3 956/5 236)、81.11%(4 247/5 236)、78.76%(4 124/5 236)及98.28%(5 146/5 236)的假定患者提供5种匹配水平的iPS供者。结论利用中华骨髓库现有的HLA资料可以建立数量少、效率高的iPS细胞库。
[Abstract]:Objective to study the feasibility of establishing high-match induced pluripotent stem cells (iPS) bank using HLA data from bone marrow bank. Methods by statistical analysis of 5 236 HLA-typing data from Changsha Laboratory of Hunan Branch of Chinese Bone Marrow Bank, we found out the homozygote data of O-type HLA-Af- BN-DRB1 locus. The matching probability of 5 236 random volunteers with hypothetical iPS donor was calculated, and the HLA haplotype frequency of random volunteers was calculated. To evaluate the matching probability of hypothetical iPS donors using high frequency haplotype homozygous volunteers of HLA type O (HLA). Results A total of 14 types of HLA haplotype homozygotes were found in 5 236 bone marrow donors, with which 61.29% (3 209 / 5 236) and 97.78% (5 120 / 5 236) of hypothetical patients were able to provide 5 matching levels of iPS donors, respectively, in 75.76% (3 967 / 5 236) and 97. 78% (5 120 / 5 236) of hypothetical patients. A total of 17 haplotypes with high frequency (HF1%) were detected. The homozygotes of these haplotypes were 64.06% (3 354 / 5 236), 75.55% (3 956 / 5 236) and 78.76% (4 124 / 5 236) and 98.28% (5 146r 5 236) of hypothetical iPS donors. Conclusion using the existing HLA data from Chinese bone marrow bank, we can establish a few and efficient iPS cell bank.
【作者单位】： 长沙血液中心;
【分类号】：R329

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2130822