一种基于新型再测序芯片的不明原因呼吸道感染样品检测方法的建立

发布时间：2019-12-03 23:17

【摘要】：再测序芯片(Resequencing Pathogen Microarray,RPM)是一种新的基于微阵列DNA芯片的病原体检测与鉴定技术。为了将RPM应用于不明原因呼吸道感染的检测,提高应对传染病暴发的能力,本研究建立了基于一种新型RPM的呼吸道多病原检测方法。该方法可以同时检测19种常见呼吸道病毒、9种甲型流感(Flu A)和11种鼻病毒(HRV)、28种肠病毒、18种少见呼吸道病毒。选取已验证的16种常见呼吸道病毒感染阳性的样本评价RPM的特异性,用克隆质粒或体外转录的RNA梯度稀释液来检验RPM的灵敏度,在10～103拷贝/反应水平时RPM仍能检测和分辨出相近的病毒亚型。将8份不明原因的咽拭子样品提取的核酸合并,用新建立的方法进行检测,根据RPM结果再以普通PCR加测序作为验证,同时和Abbott公司的质谱测序(PLEX-ID)结果进行比较,除RPM检出假阳性PIV1外,三者的其余检测结果一致。结果表明,这种基于新型RPM的方法具有高灵敏度、高通量的优点,对应对新发和突发传染病具有重要意义。

【参考文献】

相关期刊论文 前1条

1 杨宏伟,赵均秀,仇少荣,周有利,张吉才,张珍,彭敬红,吕军;呼吸道感染病原菌分布及耐药性调查[J];中华医院感染学杂志;2004年07期

【共引文献】

相关期刊论文 前2条

1 甘新华;易感人群下呼吸道医院感染病原菌分布及耐药性监测[J];中华医院感染学杂志;2005年10期

2 张豫生;亓鹏;王惠;贾丽萍;米晓森;;医院人员咽部机会致病菌与岗位相关性的研究[J];中华医院感染学杂志;2006年11期

【二级参考文献】

相关期刊论文 前1条

1 曹国强,杨肇亨,梁先万,张文俊;COPD死亡病例医院获得性支气管-肺感染[J];中华医院感染学杂志;1998年04期

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 薛文仲;张斌;王中强;陈琛;张传福;孙岩松;宋宏彬;;流感病毒的检测和分型技术研究进展[J];生物技术通讯;2011年04期

2 ;[J];;年期

3 ;[J];;年期

4 ;[J];;年期

5 ;[J];;年期

6 ;[J];;年期

7 ;[J];;年期

8 ;[J];;年期

9 ;[J];;年期

10 ;[J];;年期

相关会议论文 前2条

1 毕振强;;一种新的呼吸道病原——人细小病毒[A];山东预防医学会第二届学术年会论文汇编[C];2006年

2 郑晓群;陈小芳;林虹;张信良;吕建新;;实时逆转录聚合酶链反应快速鉴别呼吸道合胞病毒亚型[A];浙江省生物化学与分子生物学学术交流会论文集[C];2005年

相关重要报纸文章 前2条

1 记者 李天舒;我国发现一种新的呼吸道病毒[N];健康报;2008年

2 记者 刘莉;我国传染病敏感实验动物资源严重缺乏[N];科技日报;2010年

相关博士学位论文 前1条

1 刘文培;在湖南地区分离的人偏肺病毒株的基因分型及其候选疫苗的初步研究[D];中国疾病预防控制中心;2008年

相关硕士学位论文 前4条

1 刘勇军;尼帕病毒F1基因、G基因的表达及特异性高免血清制备[D];吉林大学;2007年

2 漆正宇;我国人博卡病毒的分子流行病学及衣壳蛋白独有区表达纯化的研究[D];贵州大学;2007年

3 袁立军;副粘病毒天津株HN、M基因克隆与表达的研究[D];天津医科大学;2007年

4 张海凤;仙台病毒BB1株全基因组拼接及感染性克隆表达载体研究[D];中国疾病预防控制中心;2009年

，

本文编号：2569353