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病毒宏基因组学技术及其在医学领域的应用

发布时间:2020-11-03 03:56
   病毒宏基因组学(Viral metagenomics,VM)无需知晓核酸序列,直接以环境中的病毒群落为研究对象,对研究环境中病毒的多样性、快速鉴定出已知和未知病毒,实时监测特定病毒的动态变化等具有重要价值。下一代测序(Next-generation sequencing,NGS)平台具备快速、自动化和高通量等综合优势,因此相对于一代Sanger测序技术,其测序能力大大提高。同时,近年来测序技术的不断改进、成本的不断降低、数据分析流程的普及以及对数据深入挖掘能力的显著性改进表明,在可预见的未来,病毒宏基因组测序将会成为常规检测项目,为未知病毒检测提供新的技术手段和思路。本文将从病毒宏基因组学的兴起,研究过程和在医学领域中的应用等方面进行综述。
【文章目录】:
1 病毒宏基因组学(Viral metagenomics,VM)的兴起
2 病毒宏基因组学的研究过程
    2.1 样品处理和病毒浓缩
    2.2 核酸提取和扩增
    2.3 高通量测序
        2.3.1 文库构建
        2.3.2 文库测序
    2.4 生物信息学分析
3 病毒宏基因组学的应用
    3.1 在临床检测中的应用
    3.2 在公共卫生领域的应用
4 总结和展望

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本文编号:2868057

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