转突变型A53Tα-突触核蛋白基因的帕金森模型小鼠中脑的全基因组甲基化测序分析

发布时间：2020-12-12 18:30

　　【目的】研究帕金森氏病（PD）致病基因SNCA在A53T位置突变后对转基因小鼠中脑多巴胺,神经元DNA甲基化修饰的影响。【方法】分别取转突变的人源α-突触核蛋白（hα-syn）即hA53Tα-syn基因小鼠和对照组小鼠的中脑组织,采用重亚硫酸盐测序法（BS-seq）分别对12月龄的转基因小鼠和非转基因（nTg）小鼠进行全基因组甲基化分析,随后筛选出差异甲基化区域（DMR）用于GO富集分析。【结果】通过对比分析,我们总计发现481个DMR,其中高甲基化与低甲基化DMR分别有257和224个,包括与泛素降解途径相关的Ubqln2、HECTD4、Rnf157基因,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PINK1等基因。富集结果显示,差异甲基化基因总共映射到545个GO子条目,且主要富集于解剖结构发育、树突发育、神经系统发育、神经元投射等条目。【结论】帕金森致病基因SNCA在A53T位置的突变可诱导小鼠中脑多巴胺神经元DNA甲基化改变。 

【文章来源】：中山大学学报(医学版). 2020年01期 北大核心

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【部分图文】：

基因型鉴定结果

我们获得了每个样本的甲基化测序结果，染色体甲基化分布图谱如图2所示。对不同序列背景下mC的比例进行了统计，如表1所示，我们发现无论是Pitx3/A53T组（97.09%,n=2）还是nTg组（96.86%,n=2),mC都基本集中于mCG序列背景下。2.3 差异甲基化分析

差异甲基化基因映射到545个GO子条目（图4）。如图5，通过GO富集分析，我们发现DMR所在基因涉及到树突发育、解剖结构发育、神经系统发育等功能；从细胞组成成分来看，差异甲基化基因的表达产物主要存在于树突、神经元投射纤维和细胞膜上。3 讨论


本文编号：2913066