Lrrc34在精原干细胞中高表达，且为体外精原干细胞增殖的必需因子（英文）

发布时间：2020-12-13 08:35

　　目的探讨维持精原干细胞及其干细胞特性的关键基因及亮氨酸重复序列（LRR）家族成员Lrrc34在小鼠精原干细胞中的功能。方法应用差异表达基因（DEG）分析、基因本体（GO）分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析等生物信息学方法寻找潜在的多能性相关基因。分别采用逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）、免疫荧光（IF）检测Lrrc34在小鼠精原干细胞中的m RNA和蛋白质表达水平。采用RNA干扰实验研究Lrrc34敲低后对体外培养精原干细胞的瞬时效应。结果我们分别在ID4-EGFP+（G）和ID4-EGFP+/TSPAN8High （TH）、G和ID4-EGFP+/TSPAN8Low （TL）、TH和TL组发现了8、8、11个差异表达基因,并在这些差异表达基因组成的相互作用网络中发现了11个显著的相互作用模块。第五个相互作用模块中与纤维母细胞生长因子2存在相互作用的差异表达基因Lrrc34被选择作为多能性相关候选基因。免疫荧光实验显示Lrrc34特异表达于被LIN28A标记的未分化精原细胞的部分亚群中,RT-PCR证明了Lrrc34高表达于出生后7天和成年小鼠的精原干细胞中。Lrrc3... 

【文章来源】：Chinese Medical Sciences Journal. 2020年01期

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
MATERIALS AND METHODS
    Materials
    Data downloading and DEG analysis
    GO and KEGG pathway enrichment analyses
    Construction of the PPI network
    SOM clustering
    Isolation of testis cells and enrichment of THY1+spermatogonia
    Immunofluorescent assay
    Quantitative real-time PCR
    In vitro SSC culture
    RNA interference by siRNA
    Statistical analysis
RESULTS
    Identification of DEGs among P6 ID4-EGFP+spermatogonia
    PPI network of DEGs among P6 ID4-EGFP+spermatogonia and module analysis
    LRRC34 is highly expressed in SSCs from P7 and adult C57BL/6 male mice
    The knockdown of Lrrc34 led to variations in the transcriptome signaling pathway in SSC colonies in vitro
DISCUSSION
Conflict of Interests Statement



本文编号：2914258