豫皖闽浙4省溪蟹并殖吸虫囊蚴核糖体ITS2和线粒体CO1基因序列分析
发布时间:2020-12-20 14:04
目的分析我国豫皖闽浙4省5地区溪蟹并殖吸虫囊蚴核糖体内转录间隔区2 (ITS2)和线粒体细胞色素c氧化酶亚基I (CO1)基因序列,鉴定并殖吸虫囊蚴虫种。方法 2018年10月至2019年9月,于安徽省休宁县蓝田镇、浙江省永嘉县、河南省济源市邵原镇、福建省政和县及漳州市等5个调查点采集溪蟹,分离溪蟹中并殖吸虫,提取囊蚴基因组DNA,PCR扩增核糖体ITS2和线粒体C01基因,测序。采用DNA Star拼接各基因测序结果,并进行各序列间的比对,同时与GenBankTM中并殖吸虫基因进行BLAST比对。基于ITS2、CO1序列,以肝片吸虫为外群,采用邻接法构建系统进化树。结果安徽省休宁县蓝田镇、浙江省永嘉县、河南省济源市邵原镇、福建省政和县及漳州市等5个调查点的溪蟹并殖吸虫囊蚴阳性率分别为82%(49/60)、41%(29/70)、55%(41/74)、65%(41/63)和45%(32/71)。ITS2、CO1扩增长度依次约为500 bp、450 bp。安徽省休宁县蓝田镇和浙江省永嘉县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与卫氏并殖吸虫(KC417492.1,AF219379.2)的相似性最高...
【文章来源】:中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2020年01期 北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
豫皖闽浙4省5地区溪蟹并殖吸虫囊蚴形态(×10)
并殖吸虫ITS2、CO1基因PCR扩增结果
安徽省休宁县蓝田镇和浙江省永嘉县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与卫氏并殖吸虫的相似性均最高(96%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,且两地基因遗传距离最近,表明两调查点获取的并殖吸虫囊蚴属于卫氏并殖吸虫,该结论与之前报告相同[27-28]。河南省济源市邵原镇溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与斯氏并殖吸虫的相似性最高(95%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,表明该调查点为斯氏并殖吸虫。福建省政和县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1序列进化关系存在明显差异,ITS2与斯氏并殖吸虫的相似性最高(98%~100%),但与斯氏并殖吸虫、宫崎并殖吸虫聚为一大支,且两虫种分支不明显;而CO1与宫崎并殖吸虫基因相似性最高(91%~94%),构建的系统进化树也聚为一支。有研究认为宫崎并殖吸虫是斯氏并殖吸虫的一个亚种,遗传距离非常接近[29],仅用核糖体ITS2序列分析不能鉴别,而线粒体CO1具有进化速率快,承受的环境选择压力较小,相对分子质量小、母系遗传、易于分析,能够为并殖吸虫的种内遗传提供更丰富的信息,所以CO1更适合于并殖吸虫的分类鉴定及系统发育研究[30-31]。因此,福建省政和县采集的溪蟹中分离的囊蚴为宫崎并殖吸虫,本研究结果进一步证明了该结论。福建省漳州市采集的囊蚴核糖体ITS2与卫氏并殖吸虫的相似性最高(100%),而CO1与三平正并殖吸虫的相似性最高(97%~99%),尽管相似性有差异,但在两者构建的系统进化树中均与三平正并殖吸虫聚为一支,此结果进一步说明CO1更适合于区分亚种关系,福建省漳州市获取的囊蚴属于三平正并殖吸虫,该结论与蔡茂荣等[24]的研究结果一致。图4 豫皖闽浙4省5地区并殖吸虫囊蚴CO1基因序列系统进化树分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]Simultaneous Paragonimus infection involving the breast and lung:A case report[J]. Moon Young Oh,Ajung Chu,Jeong Hwan Park,Jong Yoon Lee,Eun Youn Roh,Young Jun Chai,Ki-Tae Hwang. World Journal of Clinical Cases. 2019(24)
[2]并殖吸虫的分类和遗传多样性研究概述[J]. 顾梦杰,李友松,董惠芬,赵琴平. 中国人兽共患病学报. 2019(08)
[3]2013~2016年安徽省并殖吸虫病监测结果分析[J]. 刘道华,郭见多,汪天平,张世清,朱磊,金伟,方益民,汪业彬,黄建国,徐基明. 热带病与寄生虫学. 2017(03)
[4]福建省六斗山自然保护区平和华溪蟹感染三平正并殖吸虫囊蚴情况及其形态学研究[J]. 蔡茂荣,林国华,陈锦钟,罗鋆,黄明松,邓艳,程由注. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(05)
[5]安徽省重要寄生虫感染的新趋势及其影响因素[J]. 汪天平,操治国. 热带病与寄生虫学. 2017(01)
[6]济源市中小学生并殖吸虫病防治知识及行为调查[J]. 陈伟奇,张雅兰,邓艳,蔺西萌,张红卫,许汴利. 河南预防医学杂志. 2016(10)
[7]福建省政和县东部并殖吸虫病疫源地调查[J]. 林本翔,魏焕旺,李友松,吴世清,孔凡真,范治金,汤保贵,陈财. 中国血吸虫病防治杂志. 2016(04)
[8]黄山市肺吸虫第二中间宿主—溪蟹感染调查[J]. 方益民,胡新三,凌志利,汪业彬,郑瑞丰,汤以农,毕宪忠,刘道华,郭见多. 热带病与寄生虫学. 2014(04)
[9]福建省尤溪、永泰与平和县并殖吸虫病疫源地调查[J]. 程由注,李莉莎,林国华,周培聪,江典伟,方彦炎,林陈鑫,李燕榕. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2010(06)
[10]鄂赣浙3省10地并殖吸虫遗传变异的ITS2分析[J]. 梅浩砚,关飞,牛安欧. 中国人兽共患病学报. 2009(10)
本文编号:2927996
【文章来源】:中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2020年01期 北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
豫皖闽浙4省5地区溪蟹并殖吸虫囊蚴形态(×10)
并殖吸虫ITS2、CO1基因PCR扩增结果
安徽省休宁县蓝田镇和浙江省永嘉县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与卫氏并殖吸虫的相似性均最高(96%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,且两地基因遗传距离最近,表明两调查点获取的并殖吸虫囊蚴属于卫氏并殖吸虫,该结论与之前报告相同[27-28]。河南省济源市邵原镇溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与斯氏并殖吸虫的相似性最高(95%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,表明该调查点为斯氏并殖吸虫。福建省政和县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1序列进化关系存在明显差异,ITS2与斯氏并殖吸虫的相似性最高(98%~100%),但与斯氏并殖吸虫、宫崎并殖吸虫聚为一大支,且两虫种分支不明显;而CO1与宫崎并殖吸虫基因相似性最高(91%~94%),构建的系统进化树也聚为一支。有研究认为宫崎并殖吸虫是斯氏并殖吸虫的一个亚种,遗传距离非常接近[29],仅用核糖体ITS2序列分析不能鉴别,而线粒体CO1具有进化速率快,承受的环境选择压力较小,相对分子质量小、母系遗传、易于分析,能够为并殖吸虫的种内遗传提供更丰富的信息,所以CO1更适合于并殖吸虫的分类鉴定及系统发育研究[30-31]。因此,福建省政和县采集的溪蟹中分离的囊蚴为宫崎并殖吸虫,本研究结果进一步证明了该结论。福建省漳州市采集的囊蚴核糖体ITS2与卫氏并殖吸虫的相似性最高(100%),而CO1与三平正并殖吸虫的相似性最高(97%~99%),尽管相似性有差异,但在两者构建的系统进化树中均与三平正并殖吸虫聚为一支,此结果进一步说明CO1更适合于区分亚种关系,福建省漳州市获取的囊蚴属于三平正并殖吸虫,该结论与蔡茂荣等[24]的研究结果一致。图4 豫皖闽浙4省5地区并殖吸虫囊蚴CO1基因序列系统进化树分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]Simultaneous Paragonimus infection involving the breast and lung:A case report[J]. Moon Young Oh,Ajung Chu,Jeong Hwan Park,Jong Yoon Lee,Eun Youn Roh,Young Jun Chai,Ki-Tae Hwang. World Journal of Clinical Cases. 2019(24)
[2]并殖吸虫的分类和遗传多样性研究概述[J]. 顾梦杰,李友松,董惠芬,赵琴平. 中国人兽共患病学报. 2019(08)
[3]2013~2016年安徽省并殖吸虫病监测结果分析[J]. 刘道华,郭见多,汪天平,张世清,朱磊,金伟,方益民,汪业彬,黄建国,徐基明. 热带病与寄生虫学. 2017(03)
[4]福建省六斗山自然保护区平和华溪蟹感染三平正并殖吸虫囊蚴情况及其形态学研究[J]. 蔡茂荣,林国华,陈锦钟,罗鋆,黄明松,邓艳,程由注. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2017(05)
[5]安徽省重要寄生虫感染的新趋势及其影响因素[J]. 汪天平,操治国. 热带病与寄生虫学. 2017(01)
[6]济源市中小学生并殖吸虫病防治知识及行为调查[J]. 陈伟奇,张雅兰,邓艳,蔺西萌,张红卫,许汴利. 河南预防医学杂志. 2016(10)
[7]福建省政和县东部并殖吸虫病疫源地调查[J]. 林本翔,魏焕旺,李友松,吴世清,孔凡真,范治金,汤保贵,陈财. 中国血吸虫病防治杂志. 2016(04)
[8]黄山市肺吸虫第二中间宿主—溪蟹感染调查[J]. 方益民,胡新三,凌志利,汪业彬,郑瑞丰,汤以农,毕宪忠,刘道华,郭见多. 热带病与寄生虫学. 2014(04)
[9]福建省尤溪、永泰与平和县并殖吸虫病疫源地调查[J]. 程由注,李莉莎,林国华,周培聪,江典伟,方彦炎,林陈鑫,李燕榕. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2010(06)
[10]鄂赣浙3省10地并殖吸虫遗传变异的ITS2分析[J]. 梅浩砚,关飞,牛安欧. 中国人兽共患病学报. 2009(10)
本文编号:2927996
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