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豫皖闽浙4省溪蟹并殖吸虫囊蚴核糖体ITS2和线粒体CO1基因序列分析

发布时间:2020-12-20 14:04
  目的分析我国豫皖闽浙4省5地区溪蟹并殖吸虫囊蚴核糖体内转录间隔区2 (ITS2)和线粒体细胞色素c氧化酶亚基I (CO1)基因序列,鉴定并殖吸虫囊蚴虫种。方法 2018年10月至2019年9月,于安徽省休宁县蓝田镇、浙江省永嘉县、河南省济源市邵原镇、福建省政和县及漳州市等5个调查点采集溪蟹,分离溪蟹中并殖吸虫,提取囊蚴基因组DNA,PCR扩增核糖体ITS2和线粒体C01基因,测序。采用DNA Star拼接各基因测序结果,并进行各序列间的比对,同时与GenBankTM中并殖吸虫基因进行BLAST比对。基于ITS2、CO1序列,以肝片吸虫为外群,采用邻接法构建系统进化树。结果安徽省休宁县蓝田镇、浙江省永嘉县、河南省济源市邵原镇、福建省政和县及漳州市等5个调查点的溪蟹并殖吸虫囊蚴阳性率分别为82%(49/60)、41%(29/70)、55%(41/74)、65%(41/63)和45%(32/71)。ITS2、CO1扩增长度依次约为500 bp、450 bp。安徽省休宁县蓝田镇和浙江省永嘉县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与卫氏并殖吸虫(KC417492.1,AF219379.2)的相似性最高... 

【文章来源】:中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2020年01期 北大核心

【文章页数】:8 页

【部分图文】:

豫皖闽浙4省溪蟹并殖吸虫囊蚴核糖体ITS2和线粒体CO1基因序列分析


豫皖闽浙4省5地区溪蟹并殖吸虫囊蚴形态(×10)

序列,吸虫,基因,囊蚴


并殖吸虫ITS2、CO1基因PCR扩增结果

序列,吸虫,囊蚴,进化树


安徽省休宁县蓝田镇和浙江省永嘉县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与卫氏并殖吸虫的相似性均最高(96%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,且两地基因遗传距离最近,表明两调查点获取的并殖吸虫囊蚴属于卫氏并殖吸虫,该结论与之前报告相同[27-28]。河南省济源市邵原镇溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1与斯氏并殖吸虫的相似性最高(95%~100%),构建的系统进化树也聚为一支,表明该调查点为斯氏并殖吸虫。福建省政和县溪蟹并殖吸虫囊蚴ITS2、CO1序列进化关系存在明显差异,ITS2与斯氏并殖吸虫的相似性最高(98%~100%),但与斯氏并殖吸虫、宫崎并殖吸虫聚为一大支,且两虫种分支不明显;而CO1与宫崎并殖吸虫基因相似性最高(91%~94%),构建的系统进化树也聚为一支。有研究认为宫崎并殖吸虫是斯氏并殖吸虫的一个亚种,遗传距离非常接近[29],仅用核糖体ITS2序列分析不能鉴别,而线粒体CO1具有进化速率快,承受的环境选择压力较小,相对分子质量小、母系遗传、易于分析,能够为并殖吸虫的种内遗传提供更丰富的信息,所以CO1更适合于并殖吸虫的分类鉴定及系统发育研究[30-31]。因此,福建省政和县采集的溪蟹中分离的囊蚴为宫崎并殖吸虫,本研究结果进一步证明了该结论。福建省漳州市采集的囊蚴核糖体ITS2与卫氏并殖吸虫的相似性最高(100%),而CO1与三平正并殖吸虫的相似性最高(97%~99%),尽管相似性有差异,但在两者构建的系统进化树中均与三平正并殖吸虫聚为一支,此结果进一步说明CO1更适合于区分亚种关系,福建省漳州市获取的囊蚴属于三平正并殖吸虫,该结论与蔡茂荣等[24]的研究结果一致。图4 豫皖闽浙4省5地区并殖吸虫囊蚴CO1基因序列系统进化树分析

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:2927996

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