广东省一株新型肠道病毒EV-B83型的全基因组序列进化分析及重组分析

发布时间：2020-12-24 23:54

　　本研究对2001年广东省急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中分离到的一株肠道病毒AFP341_GD-CHN₂001株进行了高通量测序后,获取该全基因组序列,经鉴定该毒株为EV-B83。为了解该广东省首株EV-B83分离株的全基因组特征及其重组特点,本研究对AFP341_GD-CHN₂001毒株通过最大似然法构建系统进化树,利用bootscanning分析该毒株与其它型别肠道病毒的重组位点,最后根据该重组位点分区段构建系统进化树,进一步验证重组分析结果。全长VP1序列构建的分子进化树表明,AFP341_GD-CHN₂001毒株与EV-B83原型株及柬埔寨SEP025_KH₂012分离株形成一簇;初步构建P1、P2、P3编码区序列系统进化树,提示该分离株在其分子进化中可能存在基因重组,而bootscanning分析表明非结构蛋白编码区是其发生基因重组的区域。根据bootscannin... 

【文章来源】：病毒学报. 2020年03期 北大核心

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

基于GD341＿2001毒株及GenBank数据库现有EV-B83的VP1编码区构建的系统进化树


本文编号：2936544