HLA-DR对小鼠肠道菌群结构和丰度影响的研究
发布时间：2021-01-01 17:25
肠道菌群是人体生理、免疫系统发育、消化、发育和解毒反应的重要场所,对人体健康有着深远的影响。肠道菌群的结构和组成与多种疾病存在关联,越来越多研究证实肠道微生物群的失调与多种肠道疾病存在关联;不仅如此,最近的研究发现肠道微生物群与许多自身免疫性疾病,包括自身免疫性肝炎、脊柱炎、多发性硬化等都与肠道菌群有着千丝万缕的联系。已有研究表明,遗传因素可以影响肠道菌群的组成。Williams Turpin等,关于宿主基因组与肠道菌群的关联研究发现,三分之一的肠道菌群受遗传因素影响,他们鉴定出58个宿主SNP与33个细菌群丰度相关。Bonder等对荷兰人群1514个样本进行研究,鉴定出影响人肠道微生物组的基因座,发现在MHC位点中,存在部分与肠道微生物组成相关的SNP,例如位于MUC22基因附近的SNP,提示HLA-II类分子可调控肠道菌群导致其结构和功能的改变。在多种HLA转基因小鼠模型中,均证实HLA等位与肠道菌群存在关联,例如有研究表明在HLA-DR3AIH模型中,肠道微生物群发生了显著改变,但在C57BL/6J小鼠中没有改变,这意味着HLA等位的不同可能导致微生物群组成...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
实验方案
图 4-3 序列有效长度分布质检%的相似度对研究样本进行 OTU 分类，构建稀释曲线（ sobs（表征实际观测到的物种数目），当曲线趋向平坦，更多的数据量只会产生少量新的物种（如 OTU）。S趋向平坦时，说明测序数据量足够大，可以反映样本中信息图 4-4 稀释曲线 和 Shannon-Wiener 曲线
图 4-3 序列有效长度分布. 测序数据质检按照 97%的相似度对研究样本进行 OTU 分类，构建稀释曲线（图 4-4）。多性指数为 sobs（表征实际观测到的物种数目），当曲线趋向平坦时，说明测序据量合理，更多的数据量只会产生少量新的物种（如 OTU）。Shannon-Wiene线，曲线趋向平坦时，说明测序数据量足够大，可以反映样本中绝大多数的微物多样性信息
本文编号：2951696
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
实验方案
图 4-3 序列有效长度分布质检%的相似度对研究样本进行 OTU 分类，构建稀释曲线（ sobs（表征实际观测到的物种数目），当曲线趋向平坦，更多的数据量只会产生少量新的物种（如 OTU）。S趋向平坦时，说明测序数据量足够大，可以反映样本中信息图 4-4 稀释曲线 和 Shannon-Wiener 曲线
图 4-3 序列有效长度分布. 测序数据质检按照 97%的相似度对研究样本进行 OTU 分类，构建稀释曲线（图 4-4）。多性指数为 sobs（表征实际观测到的物种数目），当曲线趋向平坦时，说明测序据量合理，更多的数据量只会产生少量新的物种（如 OTU）。Shannon-Wiene线，曲线趋向平坦时，说明测序数据量足够大，可以反映样本中绝大多数的微物多样性信息
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