利什曼原虫K26序列应用于我国利什曼原虫分离株鉴定的价值分析
发布时间:2021-01-02 00:13
目的评价利什曼原虫K26序列应用于我国利什曼原虫分离株鉴定的价值。方法收集我国不同流行区的利什曼原虫16个分离株和6个国际参照株,培养后收集前鞭毛体,提取DNA,扩增K26序列并测序,应用ClustalX2进行序列比对,从GenBank下载同源性较高的利什曼原虫分离株的K26序列,构建系统进化树,分析我国不同流行区的利什曼原虫分离株的亲缘关系。结果我国16个利什曼原虫分离株和国际参照株DD8均扩增出单一条带,而5个非杜氏利什曼原虫复合体虫株均未扩增出任何条带。序列分析结果表明,我国人源型利什曼病流行区的3个分离株801、 KS-2和KS-6均扩增出920 bp片段,自然疫源型利什曼病流行区的4个分离株XJ771、 JIASHI-1、 JIASHI-2和JIASHI-5均扩增出491 bp片段,人犬共患型利什曼病流行区4个分离株Cy、 SC6、 Hebei-Lv和Shanxi-Yang均扩增出404 bp片段,皮肤利什曼病流行区的5个分离株KXG-Xu、 KXG-Liu、KXG-65、 KXG-918和KXG-927均扩增出449 bp片段,且各流行区内虫株间的序列一致性均为100%。各...
【文章来源】:中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2020年02期 北大核心
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 利什曼原虫分离株
1.2 主要试剂
1.3 分离株培养和DNA提取
1.4 PCR扩增和测序
1.5 序列分析和系统进化树构建
1.6 伦理批准和患者知情同意
2 结果
2.1 PCR扩增结果
2.2 分离株序列比对结果
2.3 系统进化树分析
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国不同利什曼病流行区利什曼原虫分离株核糖体内转录间隔区1的多态性分析[J]. 程芳洲,高春花,杨玥涛,汪俊云. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2019(02)
[2]利什曼原虫中国分离株SSU rDNA多变区序列分析[J]. 卜玲毅,胡孝素,敬保迁,马莹,易桃林. 实用寄生虫病杂志. 2001(01)
[3]我国内脏利什曼病山丘疫区与平原疫区利什曼原虫SSUrDNA多变区序列分析[J]. 卜玲毅,胡孝素,敬保迁,易桃林. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2000(06)
[4]中国利什曼病的现状和对开展防治工作的若干建议[J]. 管立人,瞿靖琦,柴君杰. 地方病通报. 2000(03)
[5]新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病的研究[J]. 管立人,杨元清,瞿靖琦. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 1997(03)
本文编号:2952260
【文章来源】:中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2020年02期 北大核心
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 利什曼原虫分离株
1.2 主要试剂
1.3 分离株培养和DNA提取
1.4 PCR扩增和测序
1.5 序列分析和系统进化树构建
1.6 伦理批准和患者知情同意
2 结果
2.1 PCR扩增结果
2.2 分离株序列比对结果
2.3 系统进化树分析
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国不同利什曼病流行区利什曼原虫分离株核糖体内转录间隔区1的多态性分析[J]. 程芳洲,高春花,杨玥涛,汪俊云. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2019(02)
[2]利什曼原虫中国分离株SSU rDNA多变区序列分析[J]. 卜玲毅,胡孝素,敬保迁,马莹,易桃林. 实用寄生虫病杂志. 2001(01)
[3]我国内脏利什曼病山丘疫区与平原疫区利什曼原虫SSUrDNA多变区序列分析[J]. 卜玲毅,胡孝素,敬保迁,易桃林. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2000(06)
[4]中国利什曼病的现状和对开展防治工作的若干建议[J]. 管立人,瞿靖琦,柴君杰. 地方病通报. 2000(03)
[5]新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病的研究[J]. 管立人,杨元清,瞿靖琦. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 1997(03)
本文编号:2952260
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