疫苗候选抗原Pvs48/45在中缅边境的遗传多样性特点

发布时间：2021-01-03 04:09

　　目的了解间日疟原虫传播阻断疫苗候选抗原Pvs48/45在中缅边境地区的基因多态性和自然选择特点。方法提取39例来自中缅边境主要流行区（Laiza）的间日疟原虫基因组DNA,采用巢式PCR（nest-PCR）扩增Pvs48/45基因开放阅读区（Open reading frame, ORF）;通过MEGA 4.0、DnaSP v5.10和NETWORK 4.6对Pvs48/45基因多态性和自然选择特点进行分析。结果研究发现了6个突变位点,均为非同义突变（E35K,H211N,K250N,D335Y,A376T,K418R）,导致了5种单倍型;Pvs48/45基因的核苷酸多态性水平极低（π=0.00064）,CRDⅢ区最高（π=0.00163）;多种中性检验均表明Pvs48/45基因处于平衡选择;种群进化分析和单倍型网络图显示Pvs48/45具有较强的地理分化,且H2型为中缅边境地区频率最高的单倍型。结论 Pvs48/45在中缅边境地区遗传多样性很低,且在进化过程中经历平衡选择,提示其可作为传播阻断疫苗候选靶点;Pvs48/45在全球具有较强的地理分化,应根据地区遗传特点开发更加有效的传播... 

【文章来源】：中国人兽共患病学报. 2020年01期 北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 研究地点和样本采集
    1.2 Pvs48/45基因组DNA提取,扩增和测序
    1.3 Pvs48/45基因序列组装和多态性分析
    1.4 中性检验
    1.5 种群分化
    1.6 全球单倍型网络分析
2 结 果
    2.1 Pvs48/45基因的遗传多样性
    2.2 Pvs48/45基因的中性检验
    2.3 种群分化
    2.4 单倍型网络分析
3 讨 论
4 展 望



本文编号：2954285