甲型流感病毒不同亚型混合感染分析及N9亚型流感病毒NA基因进化分析
发布时间:2021-01-05 05:17
流感病毒可引起急性呼吸道传染病并且该病毒每年都有不同规模的小流行,若干年一次全球范围的大流行,给人类健康和经济的发展带来负面影响。作为流感病毒表面包膜主要的两种糖蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA),不但与病毒的致病性有关,同时HA和NA还要承受着外界环境的选择压力,在这些选择压力之下往往会引起HA和NA的变异,也会增加产生新型病毒的可能性。本研究共分为两个方面对流感病毒不同亚型的共同感染及流感病毒的进化进行描述。希望借此为阐明流感病毒流行规律提供新的依据。第一部分目的:了解一例新甲型H1N1和季节性H3N2亚型流感混合感染病例中季节性H3N2亚型流感病毒和新甲型H1N1亚型流感病毒的HA和NA基因的变异情况。方法:鼻咽拭子的核酸样本和细胞培养物100倍稀释的核酸样本经实时荧光PCR方法鉴定流感病毒亚型。病毒经MDCK细胞培养后进行红细胞凝集试验(HA)和红细胞凝集抑制试验(HI)。分离病毒毒株,提取核酸经逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增HA和NA基因,获得测序结果与WHO推荐的疫苗株和疫苗相似毒株同源比对,使用生物信...
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
缩略语
前言
研究现状、成果
研究目的、方法
一、流感不同亚型混合感染的检测及HA和NA片段分析
1.1 对象和方法
1.1.1 资料来源
1.1.2 方法
1.2 结果
1.2.1 鼻咽拭子实时荧光PCR检测结果
1.2.2 细胞培养检测结果
1.2.3 季节性H3N2亚型流感病毒进化树分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 讨论
1.4 小结
二、甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
2.1 对象和方法
2.1.1 资料来源
2.1.2 方法
2.2 结果
2.2.1 NA进化构建结果
2.2.2 NA进化速率结果
2.2.3 进化选择压力和氨基酸置换熵值结果
2.3 讨论
2.4 小结
结论
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
综述 流感病毒NA结构功能与耐药性研究
综述参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神经氨酸酶基因进化分析[J]. 关蔚,林吉,李自雄,韩一芳,苏彤,张宏伟,曹广文. 第二军医大学学报. 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感监测及H3亚型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李晓燕,邹明,苏旭,郭丽茹,李琳,董晓春,徐文体. 环境与健康杂志. 2011(11)
[3]中国大陆季节性流感活动的时空分布特征[J]. 高燕,方立群,张勇,钱全,李亚品,徐翠玲,张烨,闫磊,杨华,柏延臣,杨红,曹务春,舒跃龙. 中华流行病学杂志. 2009 (11)
[4]流感病毒神经氨酸酶不同区域的作用[J]. 李向忠,方芳,陈则. 生命科学研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的启发式算法求解多序列比对问题[J]. 袁激光,金人超,李红涛. 华中科技大学学报(自然科学版). 2003(09)
[6]针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究[J]. 计宏凯,周晴,闻芳,季梁. 清华大学学报(自然科学版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原变异的机理[J]. 杨春,余佳. 国外医学.病毒学分册. 1999(03)
本文编号:2958097
【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校
【文章页数】:70 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
缩略语
前言
研究现状、成果
研究目的、方法
一、流感不同亚型混合感染的检测及HA和NA片段分析
1.1 对象和方法
1.1.1 资料来源
1.1.2 方法
1.2 结果
1.2.1 鼻咽拭子实时荧光PCR检测结果
1.2.2 细胞培养检测结果
1.2.3 季节性H3N2亚型流感病毒进化树分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 讨论
1.4 小结
二、甲型N9亚型流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
2.1 对象和方法
2.1.1 资料来源
2.1.2 方法
2.2 结果
2.2.1 NA进化构建结果
2.2.2 NA进化速率结果
2.2.3 进化选择压力和氨基酸置换熵值结果
2.3 讨论
2.4 小结
结论
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
综述 流感病毒NA结构功能与耐药性研究
综述参考文献
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神经氨酸酶基因进化分析[J]. 关蔚,林吉,李自雄,韩一芳,苏彤,张宏伟,曹广文. 第二军医大学学报. 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感监测及H3亚型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李晓燕,邹明,苏旭,郭丽茹,李琳,董晓春,徐文体. 环境与健康杂志. 2011(11)
[3]中国大陆季节性流感活动的时空分布特征[J]. 高燕,方立群,张勇,钱全,李亚品,徐翠玲,张烨,闫磊,杨华,柏延臣,杨红,曹务春,舒跃龙. 中华流行病学杂志. 2009 (11)
[4]流感病毒神经氨酸酶不同区域的作用[J]. 李向忠,方芳,陈则. 生命科学研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的启发式算法求解多序列比对问题[J]. 袁激光,金人超,李红涛. 华中科技大学学报(自然科学版). 2003(09)
[6]针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究[J]. 计宏凯,周晴,闻芳,季梁. 清华大学学报(自然科学版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原变异的机理[J]. 杨春,余佳. 国外医学.病毒学分册. 1999(03)
本文编号:2958097
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