登革病毒(DENV)基因组的5’和3’末端所蕴含的生物调控信息
发布时间:2021-01-19 20:20
登革病毒(Dengue virus,DENV)为正链RNA黄病毒,其基因组进入宿主细胞后经历了蛋白翻译和正链-负链-正链的RNA复制过程,病毒基因组的5’末端区域和3’末端区域的RNA序列和结构在上述过程中发挥不同的功能,病毒自身因此能更好地完成其生命活动。本文对DENV基因组末端区域各个序列和结构的基本功能,帽子结构依赖或非经典的非帽非IRES依赖的蛋白翻译,以环化为核心的5’–3’RNA长程相互作用的复制方式和3’UTR进化出的重复序列及串联结构在适应不同宿主所发挥的功能进行综述。
【文章来源】:病毒学报. 2020,36(02)北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
DENV2基因组5"和3"末端区域二级结构示意图
DENV经典翻译和非经典的非冒非IRES介导的翻译转化示意图
虽然所有证据都表明DENV基因组的5′–3′互补序列是病毒有效复制所必需的,但碱基配对并非必须通过基因组环化实现。基因组多联体理论认为,DENV基因组可以利用5′–3′互补序列反向头尾结合形成同源二聚体或多聚体。正链RNA病毒必须面对的问题是复制和翻译过程竞争同一病毒基因组RNA,而5′–3′序列互补环化或多联体化可以有效避免这种竞争,以利于复制和翻译。在多联体内部由于5′–3′序列互补使一个病毒基因组RNA的5′UTR与另一个病毒基因组RNA的3′UTR在同一个方向结合,使结合到其中一个基因组5′非翻译区SLA元件的NS5转移到另一个基因组3′非翻译区启动负链RNA的合成。从多联体5′末端开始的蛋白翻译结束时,核糖体将使其模板RNA从多联体解离,因而不会存在复制和翻译竞争同一模板的问题[26](图3b)。3.2 TL1 TL2 PK1 PK2序列在DB结构影响DENV复制中的作用
本文编号:2987652
【文章来源】:病毒学报. 2020,36(02)北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
DENV2基因组5"和3"末端区域二级结构示意图
DENV经典翻译和非经典的非冒非IRES介导的翻译转化示意图
虽然所有证据都表明DENV基因组的5′–3′互补序列是病毒有效复制所必需的,但碱基配对并非必须通过基因组环化实现。基因组多联体理论认为,DENV基因组可以利用5′–3′互补序列反向头尾结合形成同源二聚体或多聚体。正链RNA病毒必须面对的问题是复制和翻译过程竞争同一病毒基因组RNA,而5′–3′序列互补环化或多联体化可以有效避免这种竞争,以利于复制和翻译。在多联体内部由于5′–3′序列互补使一个病毒基因组RNA的5′UTR与另一个病毒基因组RNA的3′UTR在同一个方向结合,使结合到其中一个基因组5′非翻译区SLA元件的NS5转移到另一个基因组3′非翻译区启动负链RNA的合成。从多联体5′末端开始的蛋白翻译结束时,核糖体将使其模板RNA从多联体解离,因而不会存在复制和翻译竞争同一模板的问题[26](图3b)。3.2 TL1 TL2 PK1 PK2序列在DB结构影响DENV复制中的作用
本文编号:2987652
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