江苏省25株新型冠状病毒全基因组分析

发布时间：2021-02-21 19:15

　　目的分析江苏省25株新型冠状病毒（2019-nCoV）全基因组序列,研究其进化特征。方法使用高通量测序技术对确诊病例咽拭子样本进行测序,使用CLC Genomics Workbench 12.0分析单核苷酸多态性（SNP）,MEGA5.1分析病毒进化特征。结果 25株病毒共检测到52处碱基突变,进化分析显示25株病毒分成2个进化分支,分支1含有8 782和28 144位置CT连锁SNPs,而分支2此2位置突变为TC,即8 782 （ORF1ab: C8517T,同义突变）和28 144（ORF8: T251C, L84S）。分支2中5株病毒还含有24 034（S:C2 472T,同义突变）、26 729（M:T207C,同义突变）和28 077（ORF8:G184C,V62 L）连锁SNPs,聚成亚组A,不同分支/亚组在人群分布及与疾病关系无显著差异。结论 2019-nCoV出现了SNPs,其对病毒传播力、致病性等影响有待进一步研究。 

【文章来源】：中华实验和临床病毒学杂志. 2020,34(04)

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本文编号：3044794