云南省剑川县鼠疫疫源地分离菌株基因组多态性

发布时间：2021-03-12 10:26

　　目的阐明云南剑川野鼠疫源地鼠疫菌种群的演化及其与云南省其他疫源地菌株之间的遗传进化关系。方法按不同时间、不同疫点、不同分离源,随机选取24株剑川分离鼠疫菌进行研究;采用差异区段（DFR）、规律成簇的间隔短回文重复序列（CRISPRs）及多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因组多态性分析;以DFR+CRISPRs聚类分析划分簇,再以MLVA26对簇进行聚类分析。结果 24株剑川菌株中,20株菌聚为一个簇（剑川野鼠鼠疫簇）;2017年疫情分离3株菌位于丽江野鼠鼠疫簇,与丽江菌株（2017LZ）存在2个位点的差异（N2577,M23）;剩余1株为一个独立株;50年代菌株与其邻近的80年代菌株间位点差异未超过3。结论剑川原野鼠疫源地的发现时间可往前推至上世纪50年代,同时疫情还波及过家鼠和人群;剑川县境内存在2种类型的野鼠疫源地,其鼠疫防控具有复杂性,应继续加强鼠间鼠疫的动态监测。 

【文章来源】：中国人兽共患病学报. 2020,36(01)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

50株实验鼠疫菌及2株0.PE菌株基于DFR和CRISPRs位点生成的MST

20株剑川野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26的MST

剑川2017年分离菌株与丽江野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26个位点生成的MST


本文编号：3078150