中缅边境地区恶性疟原虫裂殖子表面蛋白2限制性酶切分析
发布时间:2021-04-06 18:37
目的运用PCR-RFLP技术对中缅边境地区恶性疟原虫进行MSP-2多态性分析,鉴定其等位基因类型。方法对采自云南省中缅边境地区的勐腊、腾冲和盈江,及缅甸的那威、南卡江、芒东和拉咱7个县(市)镜检为单一感染恶性疟的全血或滤纸血样,采用基于18SrRNA基因巢式PCR进行疟原虫种类鉴定,并对鉴定为恶性疟或混合感染血样进行PCR-RFLP检测。结果镜检为恶性疟的256份血样,经18SrRNA基因巢式PCR鉴定为恶性疟226份,间日疟14份,混合感染16份。PCR-RFLP检测恶性疟血样共215份,204份含有MSP-2等位基因,占94.9%。其中41份属于单一FC27家族,占20.1%;30份属于单一3D7家族,占14.7%;133份属于FC27和3D7家族混合感染,占65.2%。其余11份未检出MSP-2等位基因。FC27、3D7和FC27+3D7等位基因在9~29岁患者或2 500~100 000个疟原虫/μl血中检出率较高,分别为58.6%(102/174)、57.7%(94/163)、55.64%(74/133)和59.2%(103/174)、58.3%(95/163)、60.15%...
【文章来源】:中国病原生物学杂志. 2020,15(03)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
恶性疟患者血样采集点示意图
非洲和东南亚疟疾流行区恶性疟原虫株MSP-2多态性研究结果显示,恶性疟MSP-2基因的中间变异区经HinfⅠ限制性内切酶酶切后在FC27家族中产生115bp和137bp两条特异的酶切片段,且部分等位基因酶切后除上述两条酶切片段外还能产生1条162bp以及不同拷贝数的96bp酶切片段;3D7家族中只能产生70bp和108bp两条特异的酶切片段[8-10]。因此HinfⅠ酶切分析是RFLP分型技术中的第一步,基本能够鉴定样品中所含的MSP-2等位基因类型,而对一些酶切片段复杂的样品可再进行AluⅠ和ScrFⅠ等限制性内切酶酶切分析[11],从而提高MSP-2等位基因分型的准确性。为确保分型的准确性,本研究对所有样品均做HinfⅠ、AluⅠ、ScrFⅠ、DdeⅠ、RsaⅠ和TaqⅠ限制性内切酶酶切与分析。2.5 统计学分析
MSP-2的FC27和3D7等位基因在19~29岁患者中的分布分别占32.76%(57/174)和31.29%(51/163),在9~19岁患者分别占25.68%(45/174)和26.38%(43/163);FC27+3D7等位基因在19~29和9~19岁患者分别占33.08%(44/133)和25.56%(34/133)。各基因型在各采样点和患者年龄段中的分布如图4和图5所示。MSP-2的FC27和3D7等位基因分布按照患者年龄分组,其等位基因分布频率在中国和缅甸两个大采样点之间差异无统计学意义(χ2=10.774,P>0.05)和(χ2=9.427,P>0.05)。图4 中缅边境地区恶性疟原虫MSP-2的FC27基因型年龄分布
【参考文献】:
期刊论文
[1]境外输入性恶性疟原虫药物抗性基因多态性分析[J]. 杨成运,李素华,张雅兰,周瑞敏,刘颖,钱丹,赵玉玲,许汴利,张红卫. 中国病原生物学杂志. 2018(09)
[2]赤道几内亚比奥科岛恶性疟原虫MSP-1和MSP-2基因多态性研究[J]. 陈江涛,李健,潘雪峰,Urbano Monsuy Eyi,Rocio Apicante Matesa,Maximo Miko Ondo Obono,Carlos Sala Ehapo,查广才,黄广,黄芝秀,林敏. 中国当代医药. 2017(13)
[3]2015年中缅边境盈江县疟疾疫点的调查与分析[J]. 张苍林,郭祥瑞,杨锐,杨亚明,杨中华,郑宇婷,吴超,李仕刚,蔺应学,余国翠,闫润仙,段凯霞,周子悠,田鹏,周耀武,周红宁. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(05)
[4]云南省边境地区疟原虫18S rRNA基因种类鉴定与序列分析[J]. 张苍林,周红宁,聂仁华,刘慧,王剑,李春富,杨亚明. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(03)
[5]Nest-PCR和PCR-RFLP在恶性疟原虫地理株基因分型及多态性研究中的应用[J]. 张青锋,胡晶莹,杨月欣,潘卫庆. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2008(02)
[6]海南省恶性疟原虫MSP1和MSP2等位基因分型研究[J]. 江钢锋,宋杰,陈沛泉,王善青. 华南预防医学. 2003(02)
[7]套式PCR用于海南省恶性疟原虫裂殖子表面蛋白1和2的分型研究[J]. 宋杰,江钢锋,陈沛泉. 热带医学杂志. 2002(03)
[8]云南和海南两省不同地区恶性疟原虫裂殖子表面蛋白2基因型的研究[J]. 诸欣平,周蕾,张新梅,杨静,杨雅平. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2001(01)
本文编号:3121923
【文章来源】:中国病原生物学杂志. 2020,15(03)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
恶性疟患者血样采集点示意图
非洲和东南亚疟疾流行区恶性疟原虫株MSP-2多态性研究结果显示,恶性疟MSP-2基因的中间变异区经HinfⅠ限制性内切酶酶切后在FC27家族中产生115bp和137bp两条特异的酶切片段,且部分等位基因酶切后除上述两条酶切片段外还能产生1条162bp以及不同拷贝数的96bp酶切片段;3D7家族中只能产生70bp和108bp两条特异的酶切片段[8-10]。因此HinfⅠ酶切分析是RFLP分型技术中的第一步,基本能够鉴定样品中所含的MSP-2等位基因类型,而对一些酶切片段复杂的样品可再进行AluⅠ和ScrFⅠ等限制性内切酶酶切分析[11],从而提高MSP-2等位基因分型的准确性。为确保分型的准确性,本研究对所有样品均做HinfⅠ、AluⅠ、ScrFⅠ、DdeⅠ、RsaⅠ和TaqⅠ限制性内切酶酶切与分析。2.5 统计学分析
MSP-2的FC27和3D7等位基因在19~29岁患者中的分布分别占32.76%(57/174)和31.29%(51/163),在9~19岁患者分别占25.68%(45/174)和26.38%(43/163);FC27+3D7等位基因在19~29和9~19岁患者分别占33.08%(44/133)和25.56%(34/133)。各基因型在各采样点和患者年龄段中的分布如图4和图5所示。MSP-2的FC27和3D7等位基因分布按照患者年龄分组,其等位基因分布频率在中国和缅甸两个大采样点之间差异无统计学意义(χ2=10.774,P>0.05)和(χ2=9.427,P>0.05)。图4 中缅边境地区恶性疟原虫MSP-2的FC27基因型年龄分布
【参考文献】:
期刊论文
[1]境外输入性恶性疟原虫药物抗性基因多态性分析[J]. 杨成运,李素华,张雅兰,周瑞敏,刘颖,钱丹,赵玉玲,许汴利,张红卫. 中国病原生物学杂志. 2018(09)
[2]赤道几内亚比奥科岛恶性疟原虫MSP-1和MSP-2基因多态性研究[J]. 陈江涛,李健,潘雪峰,Urbano Monsuy Eyi,Rocio Apicante Matesa,Maximo Miko Ondo Obono,Carlos Sala Ehapo,查广才,黄广,黄芝秀,林敏. 中国当代医药. 2017(13)
[3]2015年中缅边境盈江县疟疾疫点的调查与分析[J]. 张苍林,郭祥瑞,杨锐,杨亚明,杨中华,郑宇婷,吴超,李仕刚,蔺应学,余国翠,闫润仙,段凯霞,周子悠,田鹏,周耀武,周红宁. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(05)
[4]云南省边境地区疟原虫18S rRNA基因种类鉴定与序列分析[J]. 张苍林,周红宁,聂仁华,刘慧,王剑,李春富,杨亚明. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2016(03)
[5]Nest-PCR和PCR-RFLP在恶性疟原虫地理株基因分型及多态性研究中的应用[J]. 张青锋,胡晶莹,杨月欣,潘卫庆. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2008(02)
[6]海南省恶性疟原虫MSP1和MSP2等位基因分型研究[J]. 江钢锋,宋杰,陈沛泉,王善青. 华南预防医学. 2003(02)
[7]套式PCR用于海南省恶性疟原虫裂殖子表面蛋白1和2的分型研究[J]. 宋杰,江钢锋,陈沛泉. 热带医学杂志. 2002(03)
[8]云南和海南两省不同地区恶性疟原虫裂殖子表面蛋白2基因型的研究[J]. 诸欣平,周蕾,张新梅,杨静,杨雅平. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2001(01)
本文编号:3121923
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