申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析

发布时间：2021-05-12 04:10

　　目的:初步预测及分析申克孢子丝菌（Sporothrix schenckii,Ss.）对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因（4Hppd）编码蛋白的结构和生物学功能特征。方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss. 4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征。结果:Ss. 4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52. 0 k D,等电点为5. 98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中。其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度。结论:预测Ss. 4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考。 

【文章来源】：皮肤性病诊疗学杂志. 2020,27(02)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1对象与方法
    1.1对象
    1.2方法
        1.2.1 Ss.4Hppd基因鉴定
        1.2.2 Ss.4HppD蛋白序列分析
2结果
    2.1 Ss.4Hppd基因鉴定
    2.2 Ss.4HppD的理化性质
    2.3 Ss.4HppD的二级结构及三级结构
    2.4 Ss.4HppD的信号肽、跨膜区域、亚细胞定位
    2.5 Ss.4HppD的功能域及修饰位点
    2.6多重比对
3讨论



本文编号：3182703