青藏高原藏羚羊粪便中两个细菌新种的分类鉴定和基因组分析

发布时间：2021-08-28 05:41

　　目的许多野生动物是重要人类传染病病原体的自然宿主,尤其是分布在高原和热带等特殊环境和气候条件的野生动物,可能携带和传播已知和未知病原体。这些病原体一旦接触并感染人类,可能引起新发传染病,造成重大公共卫生事件。青藏高原藏羚羊粪便标本中含有大量的细菌新种和未培养的细菌类群,本课题利用培养组学的思路设计培养方案,对藏羚羊粪便标本中含有的未知细菌和病原体进行分离和鉴定,这有助于扩宽我们对青藏高原野生动物粪便（肠道）菌群多样性的研究,还为应对、预防控制未来可能发生的新传染病提供科学依据。方法（1）借鉴培养组学的方法,通过多组合方式设计72种培养条件对2014年5月13至15日采集于青海可可西里国家级自然保护区的104份藏羚羊粪便进行细菌分离培养。根据菌落形态多样性原则（菌落颜色,大小,质地,边缘状况等）进行单菌落的挑取和传代纯化。细菌分离株基因组核酸制备后,扩增16S rRNA基因和进行序列测定。通过GeneBank和EzTaxon数据库对获得的菌株16S rRNA基因序列进行比对,完成菌株初步鉴定。根据以上结果,按照菌株多样性原则进行菌株甘油管的长期保存。（2）根据菌株初步鉴定结果,对所分离的... 

【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区

【文章页数】：131 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

藏羚羊粪便中分离菌株的分类学分析

图 1-2. 藏羚羊粪便中可培养细菌属水平分析Figure 1-2. The genus analysis of cultured strains isolated from the feces of Tibetan antelope如图 1-3 所示，根据 16S rRNA 基因序列和数据库多条序列的 16S rRNA 基因序列的一致性低于 98.7%，有 67 株菌鉴定为疑似细菌新种，包含 21 个菌种 ， 隶 属 于 14 个 菌 属 （ Cellulomonas, Georgenia, Microbacterium,Mycobacterium, Nocardioides, Rhodococcus, Bacillus, Paraliobacillus,Streptococcus, Devosia, Pseudescherichia, Nevskia, Roseomonas, Shimwellia）。其中有 28 株菌可能具有医学意义，可分为 6 个菌种，4 个菌属（Streptococcus,Mycobacterium, Rhodococcus 和 Roseomonas）。

图 1-3. 藏羚羊粪便分离的疑似细菌新种Figure 1-3. The potential new species isolated from the feces of Tibetan antelope.发现和命名侯云德类诺卡氏菌.1 菌株分离类诺卡氏菌属（Nocardioides）是一类进化相近、形态相似的放线菌。分类学地位属于放线菌门，放线菌纲，放线菌目，丙酸杆菌亚目，类诺氏菌科，是类诺卡氏菌科中的典型属。本次研究我们从两份不同地理位（经纬度为：35°21 55.7″N/93°26 38″E 和 35°30 0″N/93°51 35.9″E）采集藏羚羊粪便样本中，取 1g 样本加 200μL 无菌水稀释并涂布于 BHI-5%脱

【参考文献】：
期刊论文
[1]藏羚羊种群资源及其保护[J]. 吴晓民,张洪峰.  自然杂志. 2011(03)
[2]东祁连山不同高寒草地类型土壤表层碳、氮、磷密度特征[J]. 杨成德,龙瑞军,陈秀蓉,徐长林,王进明.  中国草地学报. 2008(01)
[3]青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地简介[J]. 朱锦沁,李超,慕有.  地方病通报. 1996(03)
[4]微生物数值分类法简介[J]. 徐浩.  微生物学通报. 1974(03)



本文编号：3367914