基于背景估计的三维脑显微图像信号强度校正方法研究
发布时间:2022-04-19 18:27
在神经科学研究中,从单神经元水平对神经环路结构的研究有助于理解大脑的运行机制和工作原理。借助显微光学切片断层成像系统可以获取大脑中的神经纤维等精细结构图像,通过这些图像数据,人们可以在单神经元分辨率水平上研究神经环路。然而,由于成像时的光照不均、切片过程不稳定等因素的影响,采集的原始图像往往存在信号强度不均的问题,主要表现为背景亮度不均匀以及无规律的切削伪影,这为后期的图像数据定量分析带来了困难。针对上述不同因素导致的图像信号强度不均的问题,本文提出了不同的校正方法。对于图像背景亮度不均的问题,采用一种改进的回顾法,首先对不均匀背景建立模型,之后利用优化算法估计最优的模型参数,最后采用该参数对图像进行校正。对于图像中无规律的切削伪影,由于其分布没有规律,不能建立背景模型,本文提出基于灰阶形态学的处理方法,通过形态学开闭操作组合提取不均匀的背景,最后对原图和背景求差,得到校正后的结果。采用本文提出的校正方案,分别对全脑范围的荧光标记图像和尼氏染色图像进行校正,并采用多个定量指标对处理前后的图像质量进行准确、客观的定量评估。校正结果表明改进回顾法可以校正图像背景亮度不均,校正后的图像中神经...
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 课题研究背景和意义
1.2 国内外研究现状
1.3 本文研究内容和目标
2 图像背景分析及基本研究思路
2.1 鼠脑图像数据来源
2.2 图像背景特征分析
2.3 背景亮度不均校正的研究思路
2.4 全脑图像信号强度校正的研究框架
2.5 本章小结
3 背景亮度不均的灰度校正
3.1 绿色荧光图像背景亮度不均的校正
3.2 红色荧光图像背景亮度不均的校正
3.3 实验结果和分析
3.4 本章小结
4 切削伪影的灰度校正
4.1 条带图像内亮度不均的灰度校正
4.2 冠状面切削伪影的灰度校正
4.3 实验结果和分析
4.4 本章小结
5 总结和展望
5.1 工作总结
5.2 工作的创新点
5.3 工作展望
致谢
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]脑空间信息学——连接脑科学与类脑人工智能的桥梁[J]. 骆清铭. 中国科学:生命科学. 2017(10)
[2]脑科学与类脑研究概述[J]. 蒲慕明,徐波,谭铁牛. 中国科学院院刊. 2016(07)
[3]大脑皮层内活动依赖的神经环路结构可塑性研究进展[J]. 饶小平,许智祥,徐富强. 动物学研究. 2012(05)
[4]无边界效应D小波软阈值法去除肉品图像斑点噪声[J]. 贾渊,彭增起,刘涌,蒋勇. 微计算机信息. 2011(07)
[5]抑郁症患者边缘系统-皮层-纹状体-苍白球-丘脑神经环路相关结构的磁共振成像研究[J]. 赖丽莎,陈少琼,张建生,邓星河,康庄,单鸿. 中华临床医师杂志(电子版). 2010(06)
[6]图像平场校正方法的扩展应用研究[J]. 江孝国,张开志,李成刚,王远. 光子学报. 2007(09)
[7]光学遥感影像的自动匀光处理及应用[J]. 李德仁,王密,潘俊. 武汉大学学报(信息科学版). 2006(09)
[8]数字视频图像质量客观测量方法的改进与实现[J]. 黄文辉,陈仁雷,张家谋. 北京邮电大学学报. 2005(04)
[9]基于改进的小波软阈值法的SAR图像去噪[J]. 张微,孙蓉桦,章孝灿. 遥感信息. 2004(04)
[10]光纤锥耦合CCD相机图像的平场校正方法[J]. 江孝国,祁双喜,王婉丽,王伟. 强激光与粒子束. 2004(11)
硕士论文
[1]小鼠初级运动皮层锥体神经元形态及投射路径的初步分析[D]. 贾雪艳.华中科技大学 2017
[2]TDI-fMOST系统的图像预处理方法研究[D]. 贾瑶.华中科技大学 2017
[3]灵巧卫星遥感图像拼接算法研究[D]. 齐冰洁.中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 2016
[4]显微光学切片断层图像预处理方法研究[D]. 丁文祥.华中科技大学 2013
本文编号:3646408
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 课题研究背景和意义
1.2 国内外研究现状
1.3 本文研究内容和目标
2 图像背景分析及基本研究思路
2.1 鼠脑图像数据来源
2.2 图像背景特征分析
2.3 背景亮度不均校正的研究思路
2.4 全脑图像信号强度校正的研究框架
2.5 本章小结
3 背景亮度不均的灰度校正
3.1 绿色荧光图像背景亮度不均的校正
3.2 红色荧光图像背景亮度不均的校正
3.3 实验结果和分析
3.4 本章小结
4 切削伪影的灰度校正
4.1 条带图像内亮度不均的灰度校正
4.2 冠状面切削伪影的灰度校正
4.3 实验结果和分析
4.4 本章小结
5 总结和展望
5.1 工作总结
5.2 工作的创新点
5.3 工作展望
致谢
参考文献
【参考文献】:
期刊论文
[1]脑空间信息学——连接脑科学与类脑人工智能的桥梁[J]. 骆清铭. 中国科学:生命科学. 2017(10)
[2]脑科学与类脑研究概述[J]. 蒲慕明,徐波,谭铁牛. 中国科学院院刊. 2016(07)
[3]大脑皮层内活动依赖的神经环路结构可塑性研究进展[J]. 饶小平,许智祥,徐富强. 动物学研究. 2012(05)
[4]无边界效应D小波软阈值法去除肉品图像斑点噪声[J]. 贾渊,彭增起,刘涌,蒋勇. 微计算机信息. 2011(07)
[5]抑郁症患者边缘系统-皮层-纹状体-苍白球-丘脑神经环路相关结构的磁共振成像研究[J]. 赖丽莎,陈少琼,张建生,邓星河,康庄,单鸿. 中华临床医师杂志(电子版). 2010(06)
[6]图像平场校正方法的扩展应用研究[J]. 江孝国,张开志,李成刚,王远. 光子学报. 2007(09)
[7]光学遥感影像的自动匀光处理及应用[J]. 李德仁,王密,潘俊. 武汉大学学报(信息科学版). 2006(09)
[8]数字视频图像质量客观测量方法的改进与实现[J]. 黄文辉,陈仁雷,张家谋. 北京邮电大学学报. 2005(04)
[9]基于改进的小波软阈值法的SAR图像去噪[J]. 张微,孙蓉桦,章孝灿. 遥感信息. 2004(04)
[10]光纤锥耦合CCD相机图像的平场校正方法[J]. 江孝国,祁双喜,王婉丽,王伟. 强激光与粒子束. 2004(11)
硕士论文
[1]小鼠初级运动皮层锥体神经元形态及投射路径的初步分析[D]. 贾雪艳.华中科技大学 2017
[2]TDI-fMOST系统的图像预处理方法研究[D]. 贾瑶.华中科技大学 2017
[3]灵巧卫星遥感图像拼接算法研究[D]. 齐冰洁.中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 2016
[4]显微光学切片断层图像预处理方法研究[D]. 丁文祥.华中科技大学 2013
本文编号:3646408
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