新型冠状病毒刺突糖蛋白氨基酸序列特征分析

发布时间：2024-02-03 11:49

　　目的探讨我国大陆新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S)的分子特征,为特效药物和疫苗的研发提供参考依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)和GenBank数据库收集2019年12月至2020年3月27日我国大陆255株新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的S蛋白基因序列,利用MEGA6.0软件分析S蛋白氨基酸序列的分子变异特征。结果 255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列处于系统进化树的同一分支,同源性为96.8%～100%;bat-coronavirus-RaTG13病毒的S蛋白序列与255株SARS-CoV-2的氨基酸同源性为86.6%～93.4%。S蛋白6个关键位点和受体结合域(RBD)的3个关键位点均未发生变异,但4株病毒S蛋白的RBD域发生个别氨基酸突变。结论中国大陆SARS-CoV-2 S蛋白的氨基酸序列同源性较高,但仍需密切监测其分子特征。

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【部分图文】：

图1新型冠状病毒(SARS-CoV-2)S蛋白氨基酸种系进化树

中国大陆SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸系统进化树分析显示:从GISAID和GenBank数据库收集的255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列相互间差异较小,处于同一分支,其同源性为96.8%～100%。其中,hCoV-19/Shanghai/SH0104/2020/EP....

本文编号：3894136