3株人鼻病毒地方株的分离鉴定与VP4基因序列分析

发布时间：2024-03-09 00:19

　　人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是小儿呼吸道感染的重要病原体,具有多种基因型,定期对HRV进行病毒分离与基因序列分型,对了解病毒的变异情况具有重要价值。为了探讨HRV在安徽省蚌埠市上呼吸道感染患者咽拭子样本中的分离情况,并进行分离株HRV的衣壳蛋白(VP)4基因序列分析,本研究选择安徽省蚌埠医学院第一附属医院诊断为上呼吸道感染患者的64例咽拭子标本,采用定量聚合酶链式反应(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测HRV感染情况。将检测阳性标本感染H1-HeLa细胞进行病毒分离,对成功分离的HRV地方株进行HRV VP4基因的逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增,并采用MEGA软件进行序列分析。结果显示:qPCR检出HRV阳性6例,从中分离到3株HRV地方株。基因序列分析显示3株HRV地方株分别为HRV A型、HRV B型、HRV C型病毒株(NCBI识别序列号分别为MK820682、MK848595、MN146019...

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【部分图文】：

图1人鼻病毒（HRV）的细胞病变效应情况

当前人鼻病毒（Humanrhinovirus,HRV）已鉴定发现200多个血清型，是感染人类的病毒中血清型最多的病毒之一[9]。HRV最初是从原代猴肾细胞中分离出来的，传统上主要是通过人胚肾细胞系与部分HeLa细胞分离培养HRV。H1-HeLa细胞为HRV敏感型细胞，可用于HR....

图2人鼻病毒（HRV）地方株的VP4基因扩增

图1人鼻病毒（HRV）的细胞病变效应情况HRV基因可编码11个蛋白，其中4种结构蛋白VPl、VP2、VP3、VP4构成壳粒，形成壳体包裹RNA。VP4不暴露在壳粒表面，VPl、VP2、VP3的部分序列展示在壳粒表面[15,16]。VP4是HRV比较保守的区域，VP4几个关键位点....

图3人鼻病毒（HRV)A型MK820682病毒株的进化树

HRV基因可编码11个蛋白，其中4种结构蛋白VPl、VP2、VP3、VP4构成壳粒，形成壳体包裹RNA。VP4不暴露在壳粒表面，VPl、VP2、VP3的部分序列展示在壳粒表面[15,16]。VP4是HRV比较保守的区域，VP4几个关键位点碱基、氨基酸的变化则会影响病毒的生物学特征....

图4人鼻病毒（HRV)B型MK848595病毒株的进化树

图3人鼻病毒（HRV)A型MK820682病毒株的进化树图5人鼻病毒（HRV)C型MN146019病毒株的进化树

本文编号：3922614