基于生物信息学分析F13A1基因及蛋白质

发布时间：2024-12-22 05:28

　　 目的利用生物信息学方法对F13A1及其编码蛋白质进行分析,为F13A1的实验研究提供理论基础和新线索。方法从UCSC(http://genome.ucsc.edu/index.html)数据库检索"F13A1",下载F13A1蛋白序列,截取转录起始点上游2000 bp碱基序列作为启动子区域进行分析,分析F13A1编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区域、蛋白质结构、相互作用网络及GO注释。结果 F13A1包含多个启动区域,不存在CpG岛,但存在SRF、Sp1和AP-1等转录因子结合位点。F13A1编码蛋白是由732个氨基酸组成的无信号肽、无跨膜区域的亲水蛋白,其主要定位于细胞核,二级结构以随机卷曲为主。另外蛋白F13B、FGA、FGG、F2、FGB、FN1、SERPINF2、VWF、VEGFA、F5可能与F13A1存在相互作用。结论 F13A1基因存在多个启动子区域,拥有多个转录因子结合位点;F13A1蛋白与F13B、FGA、FGG、F2等多个蛋白质相互作用,其参与组成内质网腔、血小板α颗粒内腔以及细胞内细胞器腔等多种细胞成分,同时在血液凝固、纤维蛋白溶解和血小板活化等多种生理...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 资料来源
    1.2 方法
2 结果
    2.1 F13A1基因特征
    2.2 F13A1基因启动子分析
    2.3 F13A1基因CpG岛预测
    2.4 F13A1基因转录因子结合位点预测
    2.5 F13A1蛋白质的理化性质分析
    2.6 F13A1蛋白的亚细胞定位、信号肽和跨膜结构域预测
    2.7 F13A1蛋白二级结构与三级结构预测
    2.8 F13A1蛋白相互作用网络分析F13A1蛋白质的潜在功能
3 讨论



本文编号：4019512