肺表面活性蛋白A适配体的筛选与鉴定
发布时间:2017-09-12 09:44
本文关键词:肺表面活性蛋白A适配体的筛选与鉴定
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【摘要】:利用指数式富集的配基系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术筛选肺表面活性蛋白A(Pulmonary Surfactant Protein A,SP-A)的寡核苷酸适配体。通过对循环次数、退火温度及引物比例的优化,建立了适合的筛选体系;筛选产物经克隆测序后,用DNAMAN软件初步分析其结构。最终确定以12个循环,55℃为退火温度及80∶1为引物比的反应条件;经过9轮循环筛选,随机ssDNA库与SP-A的结合率从1.3%上升到33%;AP-3和AP-2适配体的随机区含有保守序列TAC-GT,AP-3和AP-1适配体的随机区含有保守序列ACAG,且各适配体的二级结构均以茎-环结构为主。
【作者单位】: 天津科技大学生物工程学院 教育部工业微生物重点实验室 天津市工业微生物重点实验室;
【关键词】: 肺表面活性蛋白A 指数式富集的配基系统进化 寡核苷酸适配子
【基金】:天津市科委项目(No.12ZXCXSY07500) 天津市滨海新区科委项目(No.2012-XJR21047) 科技部项目(No.12C26211600515)资助
【分类号】:R341
【正文快照】: 1引言SP-A是一种多功能糖蛋白,在调节肺表面活性物质(PS)代谢、基因表达、肺内免疫及炎症反应方面具有重要作用[1~5]。SP-A主要在肺泡Ⅱ型上皮细胞中合成,在肺外表达量很少,在肺内则为高浓度表达,表现为肺特异性[6]。SP-A分子量为28~36kDa,等电点为4.65.5。在肺泡中,SP-A一般
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1 肖燕,崔社怀;肺表面活性蛋白A在免疫炎症反应中的作用[J];免疫学杂志;2000年S1期
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,本文编号:836489
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