基于候选基因策略的脓毒症遗传易感性研究
发布时间:2021-07-27 01:19
背景和目的:脓毒症(sepsis)是指由感染引起的全身性炎症反应综合征,是创伤、烧伤、术后感染和危重病的常见并发症,可进一步发展成严重脓毒症、脓毒性休克和器官功能障碍综合征,甚至导致死亡。通过对双胞胎和收养子的研究发现遗传因素在感染性疾病的发生、发展和转归中起着重要的作用。遗传关联研究显示多种炎症基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)和脓毒症易感性相关。如白细胞介素6(interleukin6, IL6)启动子区的-174G/C可产生新的转录因子结合位点,与脓毒症发病风险显著相关。纤溶酶原激活物抑制剂1(plasminogen activator inhibitor-1, PAI-1)基因启动子区的5G/4G多态性与脓毒性休克的转归相关,携带4G/4G基因型的脓毒症患者更易发生休克。可见,机体的遗传因素在脓毒症的发生、发展和临床转归中起着重要的作用。本研究旨在鉴定与脓毒症发生、发展和转归相关的易感基因和易感SNPs,并初步探讨它们的作用机制。材料和方法:本研究基于候选基因的研究策略,采用回顾性病例-对照实验设计,对脓毒症的遗传因素...
【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:127 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
主要英文缩写一览表
摘要
Abstract
前言
第一章 基于候选基因的脓毒症遗传关联研究
第一节 材料与方法
1 研究人群的招募
1.1 脓毒症的诊断标准
1.2 病例和对照的入选和排除标准
1.3 临床和社会人口学资料的收集
2 候选基因和SNPs的选择
3 仪器设备
4 实验试剂
4.1 试剂及耗材
4.2 试剂配制
5 实验方法
5.1 DNA的提取方法
5.2 SNPs的分型方法
6 统计分析方法
第二节 结果
1 入选样本的社会人口学资料及临床特征
2 候选基因和候选SNPs
3 SNPs的分型结果
3.1 SNPs分型结果的质量控制
3.2 SNPs分型结果图
4 遗传关联分析结果
4.1 脓毒症易感性的关联分析
4.2 脓毒症严重程度的关联分析
5 关联SNPs的分析和注释
5.1 SELE-rs4656700的分析和注释
5.2 NOS2-rs2297518的分析和注释
5.3 IRAK4-rs4251569的分析和注释
第三节 小结
第二章 显著关联的SNPs的功能研究
第一节 材料与方法
1 仪器设备
2 实验试剂
2.1 试剂及耗材
2.2 试剂配制
3 细胞培养
3.1 永生化细胞系的培养
3.2 RAW264.7细胞系的培养
4 RNA的提取和cDNA的制备
4.1 RNA的提取
4.2 cDNA的制备
5 NOS2活性的检测
5.1 rs2297518在永生化细胞系中的分型
5.2 LPS刺激体系
5.3 NOS2活性检测
6 等位表达不平衡实验
6.1 rs4251569在永生化细胞系中的分型
6.2 LPS刺激体系
6.3 TaqMan qPCR实验
第二节 结果和讨论
1 NOS2活性实验的结果和讨论
1.1 rs2297518在永生化细胞系中的分型结果
1.2 NOS2活性实验的结果
1.3 NOS2-rs2297518与脓毒性休克易感性关联结果的讨论
2 IRAK4等位表达不平衡实验的结果和讨论
2.1 rs4251569在永生化细胞系中的分型结果
2.2 等位表达不平衡实验的结果
2.3 IRAK4-rs4251569与脓毒症易感性关联结果的讨论
第三节 小结
全文结论
参考文献
文献综述
参考文献
附表
论文图表索引
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]外科重症监护室645例脓毒症患者临床流行病学调查[J]. 王鸣,彭炜,蔡敏,季刚. 中国危重病急救医学. 2006(02)
本文编号:3304767
【文章来源】:北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】:127 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
主要英文缩写一览表
摘要
Abstract
前言
第一章 基于候选基因的脓毒症遗传关联研究
第一节 材料与方法
1 研究人群的招募
1.1 脓毒症的诊断标准
1.2 病例和对照的入选和排除标准
1.3 临床和社会人口学资料的收集
2 候选基因和SNPs的选择
3 仪器设备
4 实验试剂
4.1 试剂及耗材
4.2 试剂配制
5 实验方法
5.1 DNA的提取方法
5.2 SNPs的分型方法
6 统计分析方法
第二节 结果
1 入选样本的社会人口学资料及临床特征
2 候选基因和候选SNPs
3 SNPs的分型结果
3.1 SNPs分型结果的质量控制
3.2 SNPs分型结果图
4 遗传关联分析结果
4.1 脓毒症易感性的关联分析
4.2 脓毒症严重程度的关联分析
5 关联SNPs的分析和注释
5.1 SELE-rs4656700的分析和注释
5.2 NOS2-rs2297518的分析和注释
5.3 IRAK4-rs4251569的分析和注释
第三节 小结
第二章 显著关联的SNPs的功能研究
第一节 材料与方法
1 仪器设备
2 实验试剂
2.1 试剂及耗材
2.2 试剂配制
3 细胞培养
3.1 永生化细胞系的培养
3.2 RAW264.7细胞系的培养
4 RNA的提取和cDNA的制备
4.1 RNA的提取
4.2 cDNA的制备
5 NOS2活性的检测
5.1 rs2297518在永生化细胞系中的分型
5.2 LPS刺激体系
5.3 NOS2活性检测
6 等位表达不平衡实验
6.1 rs4251569在永生化细胞系中的分型
6.2 LPS刺激体系
6.3 TaqMan qPCR实验
第二节 结果和讨论
1 NOS2活性实验的结果和讨论
1.1 rs2297518在永生化细胞系中的分型结果
1.2 NOS2活性实验的结果
1.3 NOS2-rs2297518与脓毒性休克易感性关联结果的讨论
2 IRAK4等位表达不平衡实验的结果和讨论
2.1 rs4251569在永生化细胞系中的分型结果
2.2 等位表达不平衡实验的结果
2.3 IRAK4-rs4251569与脓毒症易感性关联结果的讨论
第三节 小结
全文结论
参考文献
文献综述
参考文献
附表
论文图表索引
致谢
个人简历
【参考文献】:
期刊论文
[1]外科重症监护室645例脓毒症患者临床流行病学调查[J]. 王鸣,彭炜,蔡敏,季刚. 中国危重病急救医学. 2006(02)
本文编号:3304767
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/jjyx/3304767.html
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