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2型糖尿病胰岛功能衰竭的多组学研究

发布时间:2020-11-14 00:22
   胰岛β细胞数量减少和功能缺失是T2D(type 2 diabetes,2型糖尿病)发生的重要因素,其机制非常复杂,受到大量分子动态调控。目前已报道有多种事件与该过程相关,如内质网应激(endoplasmic reticulum stress)、氧化应激(oxidative stress)、炎症通路激活及AS(alternative splicing,可变剪切)等,但缺乏系统层面的分析。为了研究胰岛衰竭的分子变化过程,我们选择了与人类T2D表型非常相似的GK(Goto-Kakizaki)大鼠动物模型作为研究对象。利用RNA-Seq和蛋白质组学技术,我们对4到24周不同周龄GK大鼠的胰岛组织进行了转录组和蛋白质组定量分析。研究发现GK大鼠的胰岛衰竭过程呈现出两个不同的阶段特征:在早期阶段(4到6周)胰岛细胞主要代谢类型由有氧氧化磷酸化逐渐转向无氧糖酵解,并伴随低水平炎症反应及胰岛素合成代偿性增加;而随着疾病发展,在后期阶段(8到24周)胰岛组织炎症反应急剧增强,同时β细胞功能性代偿机制丧失。通过对基因表达水平进行时序分析,我们共发现了 5551个DEGs(differential expression genes,差异表达基因),且其中大部分为首次报道与T2D相关。我们相信这些组学数据对于T2D后续研究和定量分析具有重要参考价值。此外,我们还发现了一个参与胰岛β细胞AS调控过程的新蛋白DDX1(DEAD-boxhelicase 1)。通过RNA-Seq和CLIP-Seq联合分析,我们鉴定出了数百DDX1直接靶向的ASGs(alternative splicing genes,可变剪切基因)。这些基因主要编码钙离子结合蛋白、高电压门控钙离子通道和跨膜转运体,与胰岛素分泌密切相关。抑制INS-1细胞中的DDX1蛋白表达,可引起细胞中钙离子浓度降低且胰岛素分泌过程受损,表明DDX1在胰岛β细胞AS和胰岛素分泌过程中有着重要作用。
【学位单位】:华中科技大学
【学位级别】:博士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R587.1
【部分图文】:

示意图,糖尿病,多维度,最小因子


逐渐加入了进来[43],如何进行多维度数据联合分析是现在急需解决的难题,我们需??要定义出能解释该疾病的最小因子集合,并对差异进行定量描述,这也是目前及未??来T2D精准医疗研究的重点[44]。图1.2为Florez等最新提出的糖尿病精准医疗工作??模型p2]。??CUnical-based?categortet?integrated?data?Oata-drtven?categortes??HM1c2M<9%?Ckttlmy??VI—i?蠱鱼?^? ̄??I???insuln?res^tince??重里???0?wncirionnafeof)?_?Clu?ltr3??(Wnon^/transaiftoiKS)???m?MMabotocnics?pra?t?AT?Attorwbmy??KS?A???Btoodmelaboiams?W????Trssu^-^toftoty?metaboMe?Clusltr4????dynomcs?〇cel/lvei/??Oulmicrottot.??A?Ultttylt?brtwviori??|||£?HP??图1.2精准医疗在糖尿病中的应用??示意图表示如何通过多维度的生物大数据整合来实现精准医疗在糖尿病中的应用,建立新的??疾病分类标准,达到更佳有效的治疗目的。??6??

胰腺,胰岛,转录因子,器官形成


凋亡水平明显较高[68]。但近期研宄结果表明,胰岛P细胞数量的减少是细胞新生??(neogenesis)、增殖(proliferation)和调亡共同影响的结果[7()]。其中新生胰岛P细??胞主要来自干细胞或祖细胞分化(图1.5)?[71],或其他细胞转化[72 ̄74],增殖来自胰岛??P细胞的自我复制,而凋亡则是由细胞凋亡通路触发的细胞程序性死亡。胰岛卩细胞??新生、增殖和凋亡均受到细胞内外大量的信号调控,它们的综合水平决定了胰岛P??细胞数量的多少,Erica?Manesso等利用HIP大鼠模型对这一过程进行了数学分析,??10??

剪切体,剪切因子,顺式调控元件,沉默子


华中科技大学博士学位论文??过程依赖于剪切体(spliceosome)来执行(图1.6)?[78]。其中剪切体由5个snRNP,??Ul、U2、U4/U6、U5以及近200个蛋白质共同组成,Markus?C.?Wahl等对其动态组??装和工作过程进行了详细描述[79]。顺式调控元件和反式剪切因子的作用关系被称为??“剪切密码”,其综合作用效果决定了剪切信号是促进还是抑制。具体顺式调控元??件有?ESE(exonic?splicing?enhancer,外显子剪切增强子)、ESS(exonic?splicing?silencer,??外显子剪切沉默子)、ISE(?intronic?splicing?enhancer,内含子剪切增强子)、ISS?(intronic??splicing?silencer,内含子剪切沉默子),分别对应外显子或内含子可以促进或抑制??AS发生的区域。常见的剪切因子有SR?(serine/arginine-rich?proteins,丝氛酸/精氣??酸富集蛋白)和hnRNP?(heterogeneousnuclear?RNPs,核不均一核糖核蛋白)蛋白家??族[8()]
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本文编号:2882831

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