八个阿尔茨海默病易感基因在中国北方人群中的关联研究

发布时间：2017-10-13 09:23

  本文关键词：八个阿尔茨海默病易感基因在中国北方人群中的关联研究

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【摘要】：目的在中国北方人群中识别阿尔茨海默病（AD）的易感基因，并验证其与AD的关联性。 方法1.研究人群选择北京AD患者248例，同地区年龄、性别匹配408例对照。通过文献检索和生物信息学分析，筛选出GBP2、BIN1、ADAM12、FRMD4A、SORL1、PICALM、MS4A4E、TOMM40基因及3号染色体和4号染色体区间，共10个未在中国人群中进行与AD关联性报道的候选SNPs位点。通过PCR-HRM（聚合酶链反应-高分辨率率溶解曲线）技术并结合随机抽样方法测序验证分型结果的准确性，对研究人群进行10个位点的基因分型检测。2.使用SPSS统计软件及GMDR等软件分析各位点等位基因、基因型及遗传模型频率在两组的分布，验证候选位点与中国北方人群AD风险的关联，并且分析各位点基因、基因型及遗传模型与AD临床表型的关联。探索候选位点在AD患者中携带ApoE风险基因型与非携带组间的基因型频率差异。 结果1.在中国北方人群中，筛选的10个位点有3个与AD关联，分别是rs7081208、rs3851179、rs10119（P=0.045，P=0.032，P=0.01）。2.遗传模型分析中发现：rs1425967单核苷酸多态性的基因型AG与AD有关联（P=0.002，OR=0.61）；rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT、TT、CT+TT与AD存在风险关联（P=0.032，OR=4.59；P=0.026，，OR=4.68；P=0.026，OR=4.66）；rs3851179单核苷酸多态性的基因型CT、CT+TT与AD风险关联（P=0.01，OR=1.58；P=0.021，OR=1.49）；rs10119单核苷酸多态性的基因型CT、CT+TT与AD患病风险有显著性关联（P=0.004，OR=1.684；P=0.013，OR=1.158）3.在ApoE风险基因型协同作用分析发现：rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT+TT在携带ApoE基因rs429358单核苷酸多态性风险基因CT+TT组中多于非携带组（P=0.003，OR=11.73）。4.在AD患者临床变量痴呆程度分析中发现：rs2221154单核苷酸多态性T等位基因与痴呆程度有显著性关联（P=0.003）；rs1425967单核苷酸多态性的共显模型中基因型AG与GG与痴呆程度相关（P=4.39×10-4，P=0.002）；rs7081208单核苷酸多态性的等位基因G及基因型GG与痴呆程度有显著性关联（P=0.01，P=0.01）；rs720099等位基因C及显性模型中基因型CC+CT与痴呆程度也有显著性关（P=2.24×10-16，P=0.038）。5.基因交互作用分析提示：单核苷酸多态性rs10119CC或CT-rs3851179CC或C基因间的互作关系明显，病例组患AD的风险显著高于对照组。6.危险基因型累积效应分析发现：单核苷酸多态性rs7081208、rs3851179与rs10119随着危险基因型数目的增多，病例组和对照组间含有的危险基因型数目的越多，个体患AD的风险越大（OR值由1.79增大2.09再到4.94）。 结论1. FRMD4A基因rs7081208、PICALM基因rs3851179与TOMM40基因rs10119可能是中国北方人群的AD易感基因。2.rs1425967单核苷酸多态性的基因型AG、 rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT、TT、CT+TT可能会增加AD的患病风险。3. ApoE基因rs429358单核苷酸多态性风险基因CT+TT会增加rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT+TT对AD的作用。4. rs2221154等位基因T、rs1425967基因型AG与GG、rs7081208等位基因G及基因型GG、rs720099等位基因C及显性模型中基因型CC+CT与痴呆程度相关。5. rs10119CC或CT-rs3851179CC或CT基因之间的交互作用会增加患AD的风险。6. rs7081208、rs3851179与rs10119单核苷酸多态性的危险基因型数目叠加会增加个体患AD的风险。
【关键词】：中国北方人群 阿尔茨海默病 易感位点 关联研究
【学位授予单位】：宁夏医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R749.16
【目录】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-8
• 符号说明8-12
• 前言12-17
• 1. 阿尔茨海默病概况及研究意义12-13
• 2. 阿尔茨海默病的分类13
• 3. 阿尔茨海默病的遗传学研究进展13-16
• 4. 本研究的价值16-17
• 材料与方法17-30
• 1. 研究对象的纳入排除和基本信息采集17-18
• 2. 实验仪器、试剂及部分溶液的制备18-21
• 3. 主要软件及数据库21
• 4. 实验设计及路线图21-22
• 5. 实验方法22-29
• 6. 统计学分析29-30
• 结果30-53
• 1. 受试者临床基本信息30
• 2. 10 个 SNPS 分型图谱30-34
• 3. 分型结果准确性检测34
• 4. 各位点基因型、等位基因分布频率和遗传模型关联分析34-43
• 5. 以 APOE 分层，研究 AD 关联位点在病例组中的基因型分布43
• 6. 各位点在病例组中与临床协变量分析43-50
• 7. 基因交互作用分析50-51
• 8.AD 关联 SNPS 危险基因型累积效应分析51-53
• 讨论53-61
• 1. 基因多态性位点与中国北方人群 AD 关联53-59
• 2. GMDR 分析在本研究中的意义59-60
• 3.AD 易感位点累积效应与 AD 风险60-61
• 结论61-62
• 参考文献62-71
• 综述71-85
• 综述参考文献77-85
• 致谢85-86
• 攻读学位期间发表的论文86-87
• 个人简历87-88
• 附录88-94

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 蔡江萍;李国前;慕容慎行;葛华;石炎川;洪全龙;;LRRK2基因多态性与散发性阿尔茨海默病相关性的研究[J];福建医科大学学报;2014年03期

2 惠娟;王娜娜;张毓洪;杨泽;Wandong Zhang;;ZNF224基因与阿尔茨海默病风险关联的研究[J];中国老年保健医学;2014年02期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 王大伟;KIBRA基因多态性与默认网络、执行控制网络相关性的多模态MRI研究[D];天津医科大学;2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前1条

1 孙灵芝;Aβ42诱导tau蛋白过度磷酸化的实证及初步机理[D];广东药学院;2013年

本文编号：1024067