全基因组关联研究发现影响血浆神经丝轻链水平的两个位点

发布时间：2020-03-29 20:57

【摘要】：目的:神经丝轻链(Neurofilament light,NFL)是神经丝的主要组成成分,大部分存在于中枢神经系统有髓鞘轴突中。轴突膜损伤可导致轴突中的NFL释放进入脑脊液和血浆,因此在阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease,AD)患者中,脑脊液和血浆NFL的升高一定程度上可表明轴突损伤和神经元退行性变是AD的重要病理改变。血浆NFL作为AD生物学标志物,在AD患者早期阶段开始升高,且随着病程进展其水平不断上升,其对AD诊断准确率与AD核心的脑脊液生物学标志物如总tau蛋白、磷酸化tau蛋白、Aβ42相当。以往利用脑脊液生物学标记物进行全基因组关联研究发现了多个与AD相关的风险基因,因此我们利用血浆NFL作为AD生物学标记物进行全基因组关联性研究,旨在发现新的影响血浆NFL和AD发病风险的基因突变。方法:本研究包括179名健康对照,176名轻度认知功能障碍患者(mild cognitive impairment,MCI),172名AD患者。研究采用队列来自于ADNI(Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative,ADNI)数据库,所有受试者仅限于符合所有质控条件的非西班牙裔高加索人群。血浆NFL全基因基因组关联性研究采用的是加性遗传模型,即最小等位基因的剂量依赖性效应模型,使用的分析软件为Plink软件。按照以下严格的标准来探索血浆NFL与基因多态性的关系:单核苷酸多态性(SNPs)和参与者的call rate值98%,最小等位基因频率(MAF)0.20,Hardy-Weinberg平衡测试P0.001。我们进一步使用Plink软件分析了影响血浆NFL水平的rs7943454位点与局部脑体积的相关性,采用的模型为线性回归模型。采用单因素方差分析(ANOVA)对连续变量(血浆NFL水平,局部脑体积)的差异进行分析,并采用Tukey多重比较检验进行各组变量之间的两两对比分析。结果:AD患者血浆NFL浓度较MCI患者及健康对照组均有明显升高(P0.001)。MCI患者组的血浆NFL浓度相比健康对照组也有明显升高(P=0.0007)。血浆NFL浓度与脑脊液NFL浓度在AD、MCI和健康对照组中均呈正相关。脑脊液NFL vs血浆NFL:AD(r=0.364,P=0.001),MCI(r=0.560,P0.001),健康对照(r=0.471,P0.001)。本研究发现位于LUZP2基因的单核苷酸多态性位点rs7943454,其最小等位基因T与血浆NFL浓度升高相关(P=1.39×10~(-6));GABRB2基因附近的rs640476,其最小等位基因G与AD患者组和对照组血浆NFL的降低相关(P=6.71×10~(-6))。进一步分析发现,rs7943454的最小等位基因T可显著增加AD的发病风险(OR=1.547,95%CI=1.018-2.351)。在整个队列随访一年后,通过rs7943454与脑体积的相关性分析,发现其最小等位基因T能促进右侧颞中回脑体积的萎缩(P=0.0234)。结论:通过血浆NFL的全基因组关联性研究,我们发现了rs7943454与rs640476与血浆NFL水平相关,其中位于LUZP2基因的rs7943454与AD的发病风险及右侧颞中回萎缩相关。通过基于AD内表型的全基因组关联性研究,我们发现了一个新的与AD发病风险相关的位点rs7943454。
【图文】：

图 1 脑脊液 NFL 和血浆 NFL 的相关性3 血浆 NFL 诊断 AD 的 ROC 曲线分析血浆 NFL 作为 AD 的生物学标志物，ROC 曲线分析显示其诊断 AD 的敏感性和

图 2 血浆 NFL 诊断 AD 的 ROC 曲线 与血浆 NFL 浓度相关的 SNPs如上所述，共有 527 名符合条件的研究对象纳入该研究，全部研究对象都测血浆 NFL 浓度。在校正年龄、性别、诊断信息以后，我们发现了两个有提示意
【学位授予单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R749.16

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本文编号：2606507