基于全外显子组的中国人群双向情感障碍遗传基础初探
发布时间:2020-06-06 05:37
【摘要】:双向情感障碍(Bipolar Disorders,BDs)是受遗传因素和环境因素影响的复杂疾病。双向情感障碍影响了世界上超过1%的人口。其不仅危害了众多病患的健康和生活质量,也造成了极大的经济和社会负担。在美国,其造成的社会经济负担每年达到了 1,500亿美元以上;而在中国,双向情感障碍的发病率呈逐年发展的态势。过往的遗传学研究显示,70%到80%的双向情感障碍与遗传因素有关。由于双向情感障碍的复杂性,难以建立动物疾病模型,目前,科学家多数寻求运用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)方法,通过大规模人群的比较研究,分析常见突变对双向情感障碍的影响,但己发现的常见突变只能解释100%至20%的遗传因素。此外,国际上也利用全外显子组测序技术来探究双向情感障碍的罕见致病因素,相关研究大都是基于欧洲人口或区域隔离种群,缺乏对中国人群中罕见突变对双向情感障碍影响的了解。本研究与厦门市精神卫生中心(仙乐医院)合作,严格选取了 22个根据ICD-10标准被诊断为“双向情感障碍,目前不伴有精神病症状的躁狂发作”的病患开展遗传学研究,这些患者均对奥氮平和丙戊酸钠药物能产生积极反应。我们通过对其中12个病人进行全外显子组测序,参考千人基因组和ExAC数据库的等位基因频率,筛选出了中国人群中与双向情感障碍有关的罕见突变。然后,通过剩余10个病患的全外显子组信息进行结果验证,最终确定了 88个单核苷酸变异(SNV)和20个插入删除(INDEL)跟双向情感障碍有关。这些变异共涉及了 69个非冗余基因,如GPRIN2、RHBG、MUC12等。进一步基因功能分析可知,这些突变基因的功能或染色体位置均与双向情感障碍存在某些关联。如1p36、1q22、Xq27-q28、GPRIN2、MUC12等均有文献报道其跟双向情感障碍存在关联。总之,通过这个研究,我们首次发现了若干与中国人罹患双向情感障碍相关联的遗传变异;这些变异或能帮助理解双向情感障碍产生的分子机制,辅助双向情感障碍的临床诊疗。
【图文】:
第二章材料与方法逡逑第二章材料与方法逡逑2.1研究流程逡逑研究流程主要分为:一,对病人的DNA样本进行全外显子组测序,获得外逡逑显子组的NGS数据。二,对外显子组数据进行统计分析,检测数据质量是否合逡逑格。三、对外显子组数据进行SNPCalling,获得突变位点信息并加以注释。四,逡逑双向情感障碍遗传易感位点的筛选,鉴定出潜在的致病突变。(图2.1)逡逑
2.邋5.邋2罕见突变与双向情感朿碍关联分析逡逑根据等位基因频率的筛选原则,我们选择千人基因组计划中的等位基因频率逡逑小于等于5%,,邋ExAC东亚人非精神疾病群体为1%,作为罕见突变的阈值。然后,逡逑我们选择突变发生在12个双向情感障碍患者中10个患者以丨:的突变作为双向逡逑怙感障碍的易感位点。逡逑相对危度检验为表示某个因素与某个现象发生之间的强度。在这里,我们检逡逑测某个等位基因(allele)与双向情感障碍的关联强度。我们采用相对危度检验来逡逑进行某个等位基因和双向情感障碍发生的关联分析,在这里,我们统计每个群体逡逑中各个等位基因被检测到的次数,其2X2列联表形式如下:逡逑逦表2.3等位基因分布二联表逦逡逑Number邋of邋allele逦allelel逦allele2逦total逡逑
【学位授予单位】:厦门大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R749.4
【图文】:
第二章材料与方法逡逑第二章材料与方法逡逑2.1研究流程逡逑研究流程主要分为:一,对病人的DNA样本进行全外显子组测序,获得外逡逑显子组的NGS数据。二,对外显子组数据进行统计分析,检测数据质量是否合逡逑格。三、对外显子组数据进行SNPCalling,获得突变位点信息并加以注释。四,逡逑双向情感障碍遗传易感位点的筛选,鉴定出潜在的致病突变。(图2.1)逡逑
2.邋5.邋2罕见突变与双向情感朿碍关联分析逡逑根据等位基因频率的筛选原则,我们选择千人基因组计划中的等位基因频率逡逑小于等于5%,,邋ExAC东亚人非精神疾病群体为1%,作为罕见突变的阈值。然后,逡逑我们选择突变发生在12个双向情感障碍患者中10个患者以丨:的突变作为双向逡逑怙感障碍的易感位点。逡逑相对危度检验为表示某个因素与某个现象发生之间的强度。在这里,我们检逡逑测某个等位基因(allele)与双向情感障碍的关联强度。我们采用相对危度检验来逡逑进行某个等位基因和双向情感障碍发生的关联分析,在这里,我们统计每个群体逡逑中各个等位基因被检测到的次数,其2X2列联表形式如下:逡逑逦表2.3等位基因分布二联表逦逡逑Number邋of邋allele逦allelel逦allele2逦total逡逑
【学位授予单位】:厦门大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
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本文编号:2699239
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