st6gal2在dnmt3b敲除引起的识别记忆障碍中的作用与机制探讨
【学位授予单位】:青岛大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R749.1
【图文】:
提示dnmt3b基因的敲除可能会引起DNMT3a和DNMT1 蛋白发生代偿性改变。3. WGBS 结果显示:st6gal1、st8sia2、st8sia4、ncam 甲基化水平降低差异甲基化区域 DMR 需满足三个条件:1)有差异的 C 碱基占总 C 碱基的比例大于 50%;2)DMR 长度大于 50bp;3)DMR 区域内最少含 5 个碱基。我们将基因区间划分为 up2K,5-UTR,CDS,intron,3-UTR,down2K,当鉴定的 DMR 与任意区间有关联交集达 50%以上,则定义为 DMR 关联基因。在我们的 WGBS 报告中显示,在 αCaMKII-Cre;dnmt3bflox/flox小鼠中,st6gal1、st8sia2、st8sia4、ncam 均为DMR 关联基因。在 CHH 区,st6gal1、st8sia2、st8sia4 甲基化水平分别降低 19.8%,25.7%,20.3%,主要发生在 3’UTR(19.8%,25.7%,20.3%);而 ncam 下降 33.0%,在 3’UTR(34.4%)和 CDS(44.8%)区均有差异。CHG 区的 st8sia2 和 ncam 甲基化水平分别下降 25.4%、38.7%,主要在 3’UTR(25.4%,38.4%)区。而在 CG 区仅有 ncam 在 introns 区下降 14.0%。而 st6gal1 在内含子区也存在差异甲基化(资料未显示)。ab
4.1.1 Real-time qPCR 结果显示,αCaMKII-Cre;dnmt3bflox/flox小鼠 st6gal2 基因表达显著上调我们的前期研究通过运用基因芯片技术对 dnmt3b 敲除小鼠海马区差异表达的基因进行筛选,发现 st6gal2 基因的变化最为显著。我们用 Real-time qPCR 技术对此进行了验证,结果显示,条件敲除性小鼠的 st6gal2 基因的变化同前期结果一致,均表现为显著上调,可达 2.5 倍以上(unpaired t-test,t=5.035,P<0.0001, dnmt3bflox/floxn=15,αCaMKII-Cre; dnmt3bflox/floxn=13,图 3a)。提示 st6gal2 基因的上调可能与dnmt3b 基因的敲除相关。4.1.2 Western blot 结果显示,αCaMKII-Cre;dnmt3bflox/flox小鼠 ST6Gal2 蛋白表达显著上调为了进一步验证,st6gal2 基因的改变是否会引起功能性的蛋白的变化,我们采用了 Western blot 的方法对 ST6Gal2 蛋白进行了检测。结果发现基本与 Real-timeqPCR 的结果一致。(unpaired t-test,t=4.005, P<0.01, dnmt3bflox/floxn=7, αCaMKII-Cre; dnmt3bflox/floxn=7,图 3b)。
结果 of αCaMKII-Cre;dnmt3bflox/floxmice increased significantly. unpaired3bflox/floxn=15, αCaMKII-Cre; dnmt3bflox/floxn=13. b: ST6Gal2 protein paired t-test, t=4.005, P<0.01, dnmt3bflox/floxn=7, αCaMKII-Cre; dnmqPCR 结果显示, αCaMKII-Cre;dnmt3bflox/flox小鼠 n著下调,而 st8sia4 表达未受影响们的猜想,是否 st6gal2 异常增高伴随着 st8sia 家族成员Real-time PCR 检测了海马区 DMR 关联基因的 mRNA 表sia2 表达显著下调,而 st8sia4 表达未发生变化(ncam,un5。st8sia2,unpaired t-test,t=2.552,P<0.05。st8sia4,un.05,图 4)。
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