阿尔茨海默病相关基因受高脂饮食调控的肝脏转录组学分析

发布时间：2021-03-05 04:45

　　目的研究阿尔兹海默症相关基因在肝脏中受高脂饮食的调控。方法通过提取肝脏总RNA进行测序,深入分析MS小鼠肝脏AD通路基因的表达变化,并通过PPI网络分析挖掘AD通路关键节点基因,利用荟萃分析检验关键节点基因在MS人群中的表达情况,结合mRNA水平与生化指标的相关性阐明MS诱导AD发病的机制。结果与正常小鼠比较,MS小鼠肝脏AD通路基因的表达模式明显不同。利用PPI网络分析发现高节点度基因Uqcrh、Cyc1和Uqcrq。荟萃分析结果表明三个关键节点基因在MS人群体内的表达会发生显著改变。结论高脂饮食对AD通路基因的影响可能是包括肝脏等外周器官在内全身性的而并非仅仅局限于大脑,Uqcrh、Cyc1、Uqcrq等高节点度基因可能成为研究MS诱发AD的重要靶点。 

【文章来源】：遵义医科大学学报. 2020,43(02)

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

AD通路基因在肝脏的转录轮廓分析

如图2所示,通过列举小鼠肝脏AD通路部分发生显著变化的基因表达水平,结果显示代谢综合征小鼠肝脏中,Apoe、App、Psen2和Psenen等典型的AD相关基因的表达水平发生显著变化,其中Apoe和App的表达水平在代谢综合征小鼠肝脏中显著上升,Psenen和Psen2的表达水平在代谢综合征小鼠肝脏中显著降低。2.3 小鼠肝脏AD通路基因的表达模式

利用分层聚类热图分析肝脏AD相关基因的表达水平,观察到对照组和模型组小鼠肝脏AD相关基因的表达水平有明显区别。如图3所示,红色方块表示高表达基因,绿色方块表示低表达基因,黑色方块表示无效值。图中每一列代表一个基因,其中对照组小鼠肝脏AD通路高表达基因大都聚集在左侧,而MS小鼠肝脏AD通路高表达基因大都聚集在右侧;图中每一行代表一只小鼠,如图3所示,所有对照组小鼠聚为一类,所有模型组小鼠聚为一类,组间差异明显,组内层次分明,表明MS小鼠肝脏AD通路基因已经具备与正常小鼠不同的表达模式。2.4 PPI网络的构建与分析


本文编号：3064599