抑郁障碍血浆蛋白组学和代谢组学整合分析

发布时间：2022-01-16 14:48

　　抑郁障碍（MDD）是世界上非常普遍的,具有高发病率,高致残率和高致死率的精神疾病之一。该疾病的发病因素复杂多样,并且以长期并显著的心境低落、思维迟缓、以及言语动作减少为主要临床特征。它的致病机制目前尚未明确。在本研究中,为了鉴定出抑郁障碍患者血浆中发生改变的主要蛋白质,我们整合了蛋白组学数据和前期的代谢组学研究来探索与MDD相关并且发生显著改变的通路。通过使用同位素标记（iTRAQ）和质谱串联的绝对与相对定量的蛋白组学分析手段,我们鉴定出了抑郁患者与健康对照人群血浆中表达水平发生显著改变的蛋白质,并采用IPA（Ingenuity Pathway Analysis）数据库对蛋白组学和前期研究得到的代谢组学数据进行整合分析,探索差异蛋白质和代谢物之间可能存在的关系。最终我们共筛选出了74个差异表达蛋白。生物信息学分析结果显示差异蛋白主要富集在脂质转运和代谢功能上,其中包括APOE,APOC4,APOA5和丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPINA1。通过经典通路分析,我们发现有显著改变的通路与脂质转运,炎症反应和免疫调控密切相关。对整合的差异蛋白质和代谢物的因果网络分析指出磷脂代谢过程的紊乱可能对中... 

【文章来源】：重庆医科大学重庆市

【文章页数】：46 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

抑郁障碍患者鉴定出的血浆差异蛋白质（）差异蛋白质火山图

3.4 整合分析我们使用IPA进行进一步分析差异蛋白，经典通路分析显示出排名靠前的5条通路（图2A）。这些通路与脂质转运，炎症反应和免疫相关，包括LXR/RXR激活，急性应急信号，FXR/RXR激活，内涵素介导的内源信号和B细胞发育。其中作为排名最高的经典通路，LXR/RXR激活通路对于脂质代谢的调控，炎症反应和胆固醇代谢都具有重要作用。这一发现也与我们以往的研究结果相符[20]。因此，我们上传了以往的基于LC-MS技术的抑郁障碍患者血浆代谢组学研究所得的脂质代谢物表达谱数据

重庆医科大学硕士研究生学位论文节因子来对中枢神经系统（CNS）造成重要影响。已经有研究发现帕金森（PD）疾病的实验模型中，有一些脂质呈现出普遍下调的状态。尤其是在神经炎症信号通路起着重要作用的LPC（16:0）和LPC（18:1），在疾病状态下呈现上调模式[27]。


本文编号：3592873