基于生物信息学分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍发病机制中的作用

发布时间：2023-03-20 04:27

　　目的采用生物信息学方法分析miR-30d-5p在注意缺陷多动障碍(ADHD)发病机制中的作用。方法通过TargetScan7.2、miRDB和miRTarBase数据库预测miR-30d-5p的靶基因,利用Cytoscape 3.7.1软件中的ClueGO插件对靶基因进行GO和KEGG富集分析,同时通过Cytoscape 3.7.1软件中的STRING插件构建靶蛋白互作(PPI)网络并筛选出核心基因,通过与ADHD gene数据库中已验证的ADHD相关基因对比,分析miR-30d-5p在ADHD中的作用和意义。结果 GO富集显示miR-30d-5p靶基因定位到核质、细胞内细胞器、轴突、细胞膜等细胞结构,并在神经系统中广泛参与到神经元发育、分化、神经元发生的调节、神经元投射发育、顺式调控区结合及顺式调控区序列特异性DNA结合等生物过程。KEGG富集显示miR-30d-5p靶基因显著富集在FoxO信号通路、轴突导向、海马长时程增强和神经营养信号通路。NOTCH1、KRAS、SIRT1、MAPK8、SOCS3、NEDD4、SKP2、BDNF、NEDD4L、SOCS1为miR-30d-5p预测...

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【文章目录】：
1 对象与方法
    1.1 对象
    1.2 方法
        1.2.1 miR-30-5p靶基因的预测
        1.2.2 miR-30d-5p靶基因的生物信息学分析
        1.2.3 miR-30d-5p靶基因中关键基因的蛋白互作网络构建
        1.2.4 miR-30d-5p靶基因与ADHD的联系
        1.2.5 图像绘制
2 结果
    2.1 miR-30-5p靶基因的预测
    2.2 miR-30d-5p靶基因的GO功能和KEGG信号通路富集分析
    2.3 靶基因中关键基因的PPI网络构建
    2.4 miR-30d-5p靶基因与ADHD的联系
3 讨论



本文编号：3766684