基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因

发布时间：2017-09-15 09:18

  本文关键词：基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因

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【摘要】：研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机理可能与基因有关.利用计算方法对AD基因表达数据进行挖掘,以获得AD候选致病基因,寻找治愈AD方法.结合生物信息理论应用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法处理基因表达数据:观察到AD基因表达数据具有线性相关性后,先用PCA对数据降维,再利用一维分类方法对降维后的数据聚类,然后将结果提供给模糊C均值算法作为其初始聚类数目和聚类中心.通过算法,最终识别出9个AD候选致病基因.
【作者单位】： 四川师范大学数学与软件科学学院;四川师范大学计算机科学学院;东华软件股份公司;成都理工大学管理科学学院;
【关键词】： 基因表达数据 AD候选致病基因 模糊C均值算法 主成分分析
【基金】：中国航空科学基金(2012ZD11)
【分类号】：R749.16;TP311.13
【正文快照】： AD是一种危害性极大的痴呆症.目前为止,科研工作者已成功识别出3种不同的早发性AD致病基因:APP基因、PSEN1基因、PSEN2基因及一种晚发性AD致病风险因子APOE基因[1-3].对致病基因进行研究后研发的相关药物,对治疗AD有一定的效果.研究表明AD可能为多基因遗传病,为彻底根治AD,扩

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1 陈晓红,王荫华;轻度认知功能损害——AD的极早期阶段?[J];中华神经科杂志;2002年06期

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3 别曼;;巨噬细胞迁移抑制因子在AD中的作用[J];中国病理生理杂志;2010年05期

4 吴云明，胡刚;多巴胺受体拮抗剂对AD大鼠的实验治疗学研究[J];徐州医学院学报;1996年01期

5 王瑞婷;张建新;董雅洁;;黄芩茎叶总黄酮对AD大鼠模型海马神经元超微结构的影响及抗氧化作用[J];中国老年学杂志;2010年07期

6 刘小康,包定元;新蒽环类抗肿瘤化合物AD─89对DNA的作用机理研究[J];华西医科大学学报;1996年04期

7 张s，

本文编号：855633