基于数据整合策略挖掘阿尔茨海默病易感基因

发布时间：2017-09-29 06:36

  本文关键词：基于数据整合策略挖掘阿尔茨海默病易感基因

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【摘要】：目的阐明阿尔茨海默病(AD)已知致病基因的作用与新发现的相关基因,对研究阿尔茨海默病的发病机理有非常重要的作用,为临床预防、诊断和治疗提供靶点。方法从网站数据库(OMIM、Alz Gene)搜集有关阿尔茨海默病的基因数据信息;运用多种致病基因预测工具(Endeavour、Gene Prospector、GLAD4U、Proph Net)进行生物分析,从而预测致病基因,并通过GENE、Pub Med数据库进行结果验证。结果从两个数据库中直接获取阿尔茨海默病致病基因,利用4种工具软件获取阿尔茨海默病相关基因(筛选出基因出现次数≥3的基因),将数据信息进行整合,得到一个含有25个基因的列表,这些基因包括CALHM1、ABCA7、A2M、CLU、SORL1、HFE、CD2AP、APP、ACE、PICALM、APOE、NOS3、MS4A6A、PLD3、CR1、ADAM10、MS4A4E、BLMH、PSEN1、CD33、PSEN2、MPO、APBB2、BIN1和PLAU。结论 CALHM1、ABCA7、A2M、CLU等基因与阿尔茨海默病有一定的相关性,为阿尔茨海默病基因学的进一步研究和临床治疗方面的应用提供理论依据。
【作者单位】： 首都医科大学生物医学工程学院生物信息学系;北京脑重大疾病研究院阿尔茨海默病研究所;
【关键词】： 阿尔茨海默病 数据库资源 易感基因 基因预测工具
【基金】：科技部“973”项目(No.2014CB744604) 北京市教委科技计划面上项目(No.KM201010025004;No.KM201410025013) 北京市脑重大疾病研究院基金项目(No.BIBDPXM2014_014226_000016)
【分类号】：R749.16
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本文编号：940568