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MC3T3-E1细胞流体剪切力敏感信号通路的基因芯片研究

发布时间:2018-12-09 12:54
【摘要】:目的探讨适宜流体剪切力力值及作用时间下成骨细胞差异表达基因及相关信号通路。方法通过平行板流室加力装置对盖玻片培养的MC3T3-E1细胞施加流体剪切力,提取总RNA,进行包括44 170个基因的全功能组表达谱基因芯片检测,对差异表达基因进行Pathway和GO分析,并采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RTPCR)对芯片结果进行验证。结果芯片结果显示,差异基因共有884个,其中表达增强基因444个,表达降低基因440个。Pathway分析涉及的信号通路,主要包括Notch信号通路、RIG-Ⅰ样受体信号通路等。GO分析主要涉及前列腺素的生物合成、一氧化氮介导的信号传导、钙介导的信号及细胞免疫反应等不同的功能分类。结论流体剪切力对MC3T3-E1细胞的保护作用可能与激活促进细胞生存及抑制细胞凋亡相关信号通路及生物学过程相关。
[Abstract]:Objective to investigate the differential expression genes and signal pathways of osteoblasts under suitable fluid shear stress and time. Methods the MC3T3-E1 cells cultured on the cover glass were subjected to fluid shear stress with a parallel plate flow chamber. The total RNA, was extracted to detect the full functional expression profile gene chip including 44,170 genes, and the differentially expressed genes were analyzed by Pathway and GO. The results were verified by real-time fluorescence quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction (RTPCR). Results the microarray showed that there were 884 differentially expressed genes, of which 444 were expression enhancer genes and 440 were down-regulated genes. The signal pathways involved in Pathway analysis included Notch signaling pathways. GO analysis mainly involved in the biosynthesis of prostaglandins, the signal transduction mediated by nitric oxide, the signal mediated by calcium and the cellular immune response. Conclusion the protective effect of fluid shear stress on MC3T3-E1 cells may be related to activation promoting cell survival and inhibition of apoptosis-related signaling pathways and biological processes.
【作者单位】: 山东大学口腔医院修复科;青岛大学附属医院口腔科;山东省口腔生物医学重点实验室;
【基金】:山东省自然科学基金资助项目(ZR2010HM035) 山东省医药卫生科技发展计划基金资助项目(2011WSB19002)
【分类号】:R783

【参考文献】

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【二级参考文献】

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本文编号:2369390

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