金黄地鼠口腔颊粘膜癌前病变向鳞癌转变相关致病基因和通路的筛选及分析

发布时间：2020-04-20 21:25

【摘要】： 目的:利用全基因表达芯片和相关生物信息学分析方法筛选金黄地鼠口腔颊粘膜癌前病变向鳞癌转变相关重要致病基因和通路。方法:用DMBA诱导建立金黄地鼠颊粘膜癌前病变和鳞癌模型,提取癌前病变及鳞癌组织的总RNA,合成单标Cy3荧光标记的cRNA,然后与含有41000个基因/ESTs序列的Agilent大鼠全基因表达谱芯片杂交,以Ratio≥2和Ratio≤0.5为阈值来筛选差异表达基因;对差异表达基因行GO(Gene Ontology)功能分类和pathway通路分析;用RT-PCR对部分差异表达基因进行验证。结果:金黄地鼠颊粘膜从癌前病变发展到鳞癌的过程中,共筛选到1981条差异表达基因,其中上调基因1037条,下调基因944条,已知基因1861条,未知基因120条,在已知基因中上调898条,下调963条;GO分析发现这些差异表达基因主要涉及代谢、细胞结构等14类功能基因;pathway通路分析共得到9条有显著性改变的通路,在1861条已知差异表达基因中,有14条基因在以上9条通路上发生富集;对上调基因Sparc和下调基因Casp3行RT-PCR验证结果与芯片结果相符。结论:金黄地鼠颊粘膜癌前病变发展到鳞癌主要由Casp3、Cc15、CXCL12、Cc124、Dhfr、Tyms、Vcam1、Vtn、Fn1、Apoe、Alb、Serping1、Sparc和Cyp2b13基因的异常表达导致Caspase-3激活通路、趋化因子受体粘附活性通路、E2F转录因子对DNA复制调节通路、G1/S期过渡相关调控通路、细胞表面整联蛋白相互作用通路、脂蛋白代谢通路、血小板细胞溶质钙升高相关反应通路、花生四烯酸代谢通路和细胞色素P450代谢通路的改变,最终导致口腔颊粘膜从癌前病变向鳞癌转变。因此,针对以上14个基因的靶向调控和针对以上9条通路的深入研究将为治疗和预防口腔癌前病变向鳞癌转变提供有效的方法。
【图文】：

金黄地鼠颊囊,癌前病变,肉眼,粘膜

图1.肉眼下金黄地鼠颊囊癌前病变（6周）图2.光镜下金黄地鼠颊囊粘膜粘膜癌前Fig. 1 Grossly, the hamster cheek pouch 病的改变（HE×200）premalignant lesions (6 weeks) Fig.2 1light microscope,hamster cheekpouch mucosa precancerous diseasechanges(HEx200)图3.肉眼下金黄地鼠颊囊粘膜鳞癌（12周）图4.光镜下金黄地鼠颊囊粘膜鳞（HEX200）Fig. 3 Grossly,the hamster cheek pouch Fig. 4 Light microscope,hamster cheek

金黄地鼠颊囊,粘膜,光镜,肉眼

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