变形链球菌非编码RNA的初步筛选及非编码RNA-L10-Leader的鉴定和相关检测

发布时间：2021-02-28 20:19

　　变形链球菌（Streptococcusmutans）是革兰氏阳性的兼性厌氧菌，是口腔主要的致龋细菌之一。变形链球菌通过在牙表面粘附，利用口腔中的食物残渣产酸，导致牙表面脱矿，而变形链球菌本身可以适应这种酸性环境。变形链球菌利用食物中的葡萄糖产酸，利用蔗糖合成胞外多糖进行粘附。对于变形链球菌的环境适应及毒力相关基因有大量研究，但是调控机制并不完全清楚。细菌非编码RNA（smallnon-codingRNA，sRNA）是近年来的研究热点，目前对细菌的sRNA研究主要采用生物信息学预测与实验学方法验证相结合的手段。在细菌中，sRNA可以随着生长和环境的改变，如不同的氧气、温度、渗透压、pH值等发生变化。sRNA也与细菌的毒力表达密切相关，如细菌的致病性、耐药性等。sRNA还有广泛的应用前景，如用sRNA作为致病微生物的诊断标志物；用改性肽核酸（PNAS）--sRNA的反义试剂，作为微生物感染的替代疗法等。本研究的第一部分通过4种生物信息学预测的方法，对变形链球菌UA159基因组进行系统分析，预测得到变形链球菌中的sRNA共334条，其中40条至少由两种方法预测得到。针对这40条序列，采用RT... 

【文章来源】：中国人民解放军医学院北京市

【文章页数】：79 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
缩略语表
中文摘要
Abstract
前言
第一部分 变形链球菌非编码 RNA 生物信息学预测及初步筛选
    1 材料与方法
    2 实验结果
    3 讨论
    4 结论
第二部分 变形链球菌非编码 RNA--L10-Leader 的鉴定及检测
    实验一 变形链球菌 UA159 非编码 RNA--L10-Leader 的鉴定
        1 材料与方法
        2 实验结果
        3 讨论
    实验二 变形链球菌不同临床分离株非编码 RNA--L10-Leader 的表达
        1 材料与方法
        2 实验结果
        3 讨论
    实验三 不同生长条件下变形链球菌非编码 RNA--L10-Leader 的表达
        1 材料与方法
        2 实验结果
        3 讨论
    实验四 变形链球菌非编码 RNA--L10-Leader靶mRNA 的生物信息学预测及检测
        1 材料与方法
        2 实验结果
        3 讨论
结论
参考文献
文献综述
    参考文献
致谢
个人简历


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于转录终点序列特征预测大肠杆菌sRNA[J]. 刘倩,应晓敏,吴佳瑤,查磊,李伍举.  生物物理学报. 2011(03)
[2]非编码小RNA（sraB）调控肠炎型沙门菌的抗蛋清抑菌作用[J]. 蒋惠源,曹鸣辉,曹学松,顾宏伟,曾科.  微生物学报. 2010(11)
[3]变异链球菌luxS基因对牙菌斑生物膜形成的影响研究[J]. 童忠春,倪龙兴,马丽芳,周琳,侯波,赵秀.  华西口腔医学杂志. 2009(04)
[4]LuxS基因缺失的变形链球菌突变株的构建及鉴定[J]. 于丹妮,韩福胜,韩玉植,陈杰.  中华微生物学和免疫学杂志. 2008 (03)



本文编号：3056401