3岁高龋与无龋儿童龈上菌斑微生物差异的宏基因组学分析

发布时间：2021-04-05 20:42

　　目的用16S rDNA测序技术,探讨不同龋患程度儿童乳牙龈上菌斑微生物多样性及差异。方法选择3岁龄儿童为研究对象,高龋组（dmft≥5）和无龋组（dmft=0）各12名,采集光滑面龈上菌斑,基于Ion S5TMXL平台（Thermo Fisher,美国）进行16S V4区域测序并对比分析。结果通过与SILVA132数据库比对,可注释到14个菌门、21个菌纲、53个菌目、93个菌科、150个菌属、159个菌种。Alpha多样性分析提示高龋组物种丰富度和均匀度低于无龋组。Beta多样性分析显示高龋和无龋样本群落结构相似,组间无显著分离。两组中,优势菌门为放线菌门、变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、梭杆菌门等;优势菌属为放线菌属、棒状杆菌属、奈瑟菌属、罗氏菌属、链球菌属、二氧化碳嗜纤维菌属等。LEfSe分析显示,高龋组显著丰富的微生物菌群有罗氏菌属、嗜血杆菌属、金氏菌属、龋齿罗氏菌、奈瑟杆菌等（P <0.05）;无龋组显著丰富的微生物菌群有梭杆菌门、纤毛菌属、Leptotrichia_sp_oral_clone_I

【文章来源】：中国实用口腔科杂志. 2020,13(10)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

高龋组在属水平上的物种相对丰度分布

无龋组在属水平上的物种相对丰度分布

测序数据经97%相似度水平划分绘制成稀释曲线（图3），图中每条曲线均趋于平缓，并到达平台区，且所有样本的Good′s＿coverage评估达99.8%以上，提示该测序数据量可靠，足够反映当前研究对象所包含的微生物多样性。对两组的Alpha多样性分析指数（Shannon、Simpson、Chao1、ACE指数）进行统计（表1），并进行独立样本t检验和Wilcoxon秩和检验，结果显示，高龋组Alpha多样性指数低于无龋组，但差异均无统计学意义（P>0.05），说明两组样本的物种丰富度和均匀度无显著差异。2.4 微生物群落结构（Beta多样性）分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]不同龋状况母子间口腔微生物群落结构分析[J]. 于淼,仪虹,孟玲娜,敬舒涵,吕慧.  口腔医学研究. 2010(03)



本文编号：3120070