老年人群根龋和冠部龋口腔微生物群落结构分析
发布时间：2021-04-14 11:51
研究背景:作为最常见的口腔疾病之一,龋病的病因学与防治一直是重要研究领域。随着社会人口的老龄化,老年人群中龋病的发病率逐年上升,老年人龋病的病因学研究、风险因素评估及预防越来越多地受到关注。口腔内含有大量微生物,并与龋病的发生发展密切相关,而目前关于老年人龋病的微生物组学研究相对较少且尚存争议。目的:通过研究老年人不同龋病状态下口腔微生物多样性及群落结构变化,了解包括细菌和真菌在内的老年人龋病的相关致病微生物,进一步探究冠龋与根龋在病程进展过程中的微生物结构变化差异,为老年人龋病的病因探究以及预警和防治提供依据。方法:在重庆市老年人群中选取符合纳入标准的研究对象,包括冠龋患者、根龋患者和无龋者各25人。采集龈上菌斑和龋损组织,将样本分别标记为H组（健康组）、CH组（冠龋健康牙面组）、CC组（冠龋龋损组）、RH组（根龋健康牙面组）、RC组（根龋龋损组）五组,提取各样本总DNA后分别针对细菌和真菌设计引物并进行PCR扩增,运用Illumina MiSeq高通量测序技术测序,利用QIIME、Mothur、PICRUSt、SPSS等软件进行微生物群落结构及多样性分析。结果:1、细菌群落结构分析...
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
稀释曲线Figure1Shannoncurves
.1.3 细菌种类及相对丰度所有样本门水平和属水平上的细菌种类及其相对丰度如图 2，横坐标为组坐标为物种在该样本中所占的比例，不同颜色的柱状体代表不同的物种分类长短代表该物种在总体中所占比例的大小。从图中可以看出各组样本的细菌基本类似，但相对丰度有所不同。优势菌门包括厚壁菌门（Firmicutes，27%）、放线菌门（Actinobacteria，24%）杆菌门（Bacteroidetes，17%）、变形菌门（Proteobacteria，15%）、梭杆菌Fusobacteria，12%）和 TM7 菌门（Saccharibacteria，5%），这些优势菌门占测出的细菌总量的 98.4%。优势菌属主要有放线菌（Actinomyces，11%）、链球菌（Streptococcus，11%）毛菌（Leptotrichia，9%）、奈瑟菌（Neisseria，8%）、普氏菌（Prevotella_7%）、韦荣球菌（Veillonella，6%），约占细菌总量的 50%。
图 2-2 属水平的细菌群落组成Figure 2-2 Community composition at genus level用 Kruskal-Wallis H 检验进行组间显著性差异检验，结果如图 3，纵轴表示某 分类水平下的物种名，物种对应的柱形长度表示该物种在各样本组中的平均相对丰度，不同颜色代表不同分组。最右边的数值为 P 值，0.01 < P ≤ 0.05 标记*，0.001 < P ≤ 0.01 标记**，P ≤ 0.001 标记***。在门水平上，比较 H、CH、C三组，可见随着冠龋的发展，放线菌门的丰度增加，而拟杆菌门丰度降低。对 H、RH、RC 三组进行比较，结果显示随着根龋发展，放线菌门和厚壁菌门丰度增加，而梭杆菌门、变形菌门和拟杆菌门的丰度均降低。同样地，在属水平上进行比较，可以发现冠龋发展过程中放线菌、棒状杆菌、丙酸杆菌的丰度增加，梭杆菌、普氏菌的丰度降低。而根龋发展过程中，放线菌、链球菌、丙酸杆菌丰度增加，纤毛菌、奈瑟菌、梭杆菌和二氧化碳噬纤维菌丰度降低。
【参考文献】：
期刊论文
[1]微生态调节技术在感染性疾病预防中的应用[J]. 王晖,康迪,周学东,李雨庆. 华西口腔医学杂志. 2018(05)
[2]老年根龋患者唾液菌群多样性初步分析[J]. 杨会肖,吕胡玲,陈慧姗,吴红崑. 中华老年口腔医学杂志. 2018(05)
[3]6～8岁儿童龋病相关唾液蛋白组的电喷雾离子肼—串联质谱分析[J]. 鄢国伟,黄文明,薛红蕾,贾玉焕,杨德琴. 华西口腔医学杂志. 2014(03)
[4]老年根面龋牙菌斑细菌组成的聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳分析[J]. 马善奋,梁景平,姜云涛,朱彩莲. 中华口腔医学杂志. 2011 (10)
[5]老年根面龋牙菌斑群落组成的多样性观察[J]. 马善奋,梁景平,姜云涛,朱彩莲. 上海口腔医学. 2011(04)
[6]新一代高通量技术在龋病相关的口腔菌群宏基因组学研究中的应用[J]. 凌均棨,杨芳,滕飞. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2011(04)
[7]根龋的牙位与根面易感性分析[J]. 吴文慧,彭伟,徐应军,白宇宏. 现代口腔医学杂志. 2006(05)
[8]老年牙根龋患者菌斑致病菌分析[J]. 张廷发,王猛涛,张春梅,杨圣辉. 中华老年医学杂志. 2006(02)
[9]老年根面龋临床初步分析[J]. 张丽,张彤. 中华老年口腔医学杂志. 2004(02)
[10]根面龋细菌学初步分析[J]. 李鸣宇,刘正,马瑞,朱彩莲. 临床口腔医学杂志. 2004(04)
本文编号：3137265
【文章来源】：重庆医科大学重庆市
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
稀释曲线Figure1Shannoncurves
.1.3 细菌种类及相对丰度所有样本门水平和属水平上的细菌种类及其相对丰度如图 2，横坐标为组坐标为物种在该样本中所占的比例，不同颜色的柱状体代表不同的物种分类长短代表该物种在总体中所占比例的大小。从图中可以看出各组样本的细菌基本类似，但相对丰度有所不同。优势菌门包括厚壁菌门（Firmicutes，27%）、放线菌门（Actinobacteria，24%）杆菌门（Bacteroidetes，17%）、变形菌门（Proteobacteria，15%）、梭杆菌Fusobacteria，12%）和 TM7 菌门（Saccharibacteria，5%），这些优势菌门占测出的细菌总量的 98.4%。优势菌属主要有放线菌（Actinomyces，11%）、链球菌（Streptococcus，11%）毛菌（Leptotrichia，9%）、奈瑟菌（Neisseria，8%）、普氏菌（Prevotella_7%）、韦荣球菌（Veillonella，6%），约占细菌总量的 50%。
图 2-2 属水平的细菌群落组成Figure 2-2 Community composition at genus level用 Kruskal-Wallis H 检验进行组间显著性差异检验，结果如图 3，纵轴表示某 分类水平下的物种名，物种对应的柱形长度表示该物种在各样本组中的平均相对丰度，不同颜色代表不同分组。最右边的数值为 P 值，0.01 < P ≤ 0.05 标记*，0.001 < P ≤ 0.01 标记**，P ≤ 0.001 标记***。在门水平上，比较 H、CH、C三组，可见随着冠龋的发展，放线菌门的丰度增加，而拟杆菌门丰度降低。对 H、RH、RC 三组进行比较，结果显示随着根龋发展，放线菌门和厚壁菌门丰度增加，而梭杆菌门、变形菌门和拟杆菌门的丰度均降低。同样地，在属水平上进行比较，可以发现冠龋发展过程中放线菌、棒状杆菌、丙酸杆菌的丰度增加，梭杆菌、普氏菌的丰度降低。而根龋发展过程中，放线菌、链球菌、丙酸杆菌丰度增加，纤毛菌、奈瑟菌、梭杆菌和二氧化碳噬纤维菌丰度降低。
【参考文献】：
期刊论文
[1]微生态调节技术在感染性疾病预防中的应用[J]. 王晖,康迪,周学东,李雨庆. 华西口腔医学杂志. 2018(05)
[2]老年根龋患者唾液菌群多样性初步分析[J]. 杨会肖,吕胡玲,陈慧姗,吴红崑. 中华老年口腔医学杂志. 2018(05)
[3]6～8岁儿童龋病相关唾液蛋白组的电喷雾离子肼—串联质谱分析[J]. 鄢国伟,黄文明,薛红蕾,贾玉焕,杨德琴. 华西口腔医学杂志. 2014(03)
[4]老年根面龋牙菌斑细菌组成的聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳分析[J]. 马善奋,梁景平,姜云涛,朱彩莲. 中华口腔医学杂志. 2011 (10)
[5]老年根面龋牙菌斑群落组成的多样性观察[J]. 马善奋,梁景平,姜云涛,朱彩莲. 上海口腔医学. 2011(04)
[6]新一代高通量技术在龋病相关的口腔菌群宏基因组学研究中的应用[J]. 凌均棨,杨芳,滕飞. 中华口腔医学研究杂志(电子版). 2011(04)
[7]根龋的牙位与根面易感性分析[J]. 吴文慧,彭伟,徐应军,白宇宏. 现代口腔医学杂志. 2006(05)
[8]老年牙根龋患者菌斑致病菌分析[J]. 张廷发,王猛涛,张春梅,杨圣辉. 中华老年医学杂志. 2006(02)
[9]老年根面龋临床初步分析[J]. 张丽,张彤. 中华老年口腔医学杂志. 2004(02)
[10]根面龋细菌学初步分析[J]. 李鸣宇,刘正,马瑞,朱彩莲. 临床口腔医学杂志. 2004(04)
本文编号：3137265
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