口腔鳞状细胞癌外泌体差异表达mRNA生物信息学分析

发布时间：2021-06-22 05:44

　　目的利用转录组分析口腔鳞状细胞癌细胞（Oral squamous cell cancer cells,OSCC）外泌体与正常口腔上皮细胞（Human immortalized oral epithelial cell,HOEC）外泌体mRNA之间的表达差异,为解析口腔鳞状细胞癌的发生和发展机制奠定基础。方法利用高通量测序技术检测CAL-27和HOEC外泌体mRNA表达谱,筛选出差异mRNA,对差异mRNA进行GO（Gene Ontoloty）注释和KEGG富集。结果在CAL-27细胞外泌体中鉴定到44699个mRNA,在HOEC细胞外泌体中鉴定到44761个mRNA,其中,差异表达的mRNA共471条（234个上调,237个下调）。生物信息学分析表明上述差异表达的mRNA参与了口腔癌的生物学调节功能和通路。结论口腔鳞癌细胞及口腔上皮细胞均能产生丰富的外泌体;口腔鳞状细胞癌细胞外泌体与正常口腔上皮细胞外泌体间mRNA表达谱存在较大差异,差异表达的mRNA在肿瘤的发生、发展及转移过程中可能有重要作用。 

【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：44 页

【学位级别】：硕士

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外泌体电镜图(30000)

图 2-2 外泌体电镜图( 30000)Fig 2-2 The graph of electron microscopyern blot 测定外泌体表面特异性分子标志实验结果显示，CAL-27 细胞和 HOEC 细胞外泌体表达如图 2-3 所示），进一步证明提取的物质为外泌体。

兰州大学硕士研究生论文 口腔鳞状细胞癌外泌体差异表达 mRNA 生物信息学分析mRNA(|Log2FoldChange|>2.0），但其中 SERPINS、RHOD 和 RHOB 在文献中提及与肿瘤的发生、发展有关，所以特别列出。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3242245