基于宏基因组测序的牙周炎患者口腔微生物群落研究

发布时间：2021-10-17 05:04

　　目的:通过宏基因组方法结合高通量测序技术探究牙周炎患者口腔微生物菌群的组成和功能,及其与牙周炎发生发展的相关性。方法:分别采集10名牙周炎患者的唾液和龈下菌斑样本,并提取各样本中微生物总DNA,构建宏基因组文库,进行MGISEQ-2000测序,分别使用Metaphlan2软件、Humann2软件进行生物信息学分析。结果:微生物组成分析结果显示,在属水平上,卟啉单胞菌属在唾液及龈下样本组中的平均相对丰度无统计学差异（P>0.05）;普雷沃氏菌属、噬二氧化碳细胞菌属等的相对丰度在两样本组中具有统计学差异（P<0.05）。在种水平上,副流感嗜血杆菌、浅黄奈瑟球菌等在两样本组中相对丰度差异具有统计学意义（P<0.05）。功能分析结果显示,唾液和龈下菌斑样本中贡献菌和序列的相对丰度具有统计学差异（P<0.05）。结论:龈下微生物样本对于牙周炎致病菌方面的研究可能更具代表性,利用宏基因组学研究与牙周炎疾病相关的代谢通路值得进一步发展。 

【文章来源】：口腔生物医学. 2020,11(04)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

牙周炎患者唾液及龈下菌斑微生物组成物种丰度热图

对比通路丰度数据库得出丰度较高的为辅A代谢通路(coenzyme A pathway,COA-PWY)。根据牙周炎患者口腔微生物样本测得的数据，在微生物菌种及序列水平上进行微生物功能分析，基于观察COA-PWY绘制基因丰度柱状图，样本中各贡献菌或序列的相对丰度情况见图2。T.forsythia、聚核梭杆菌(Fusobacterium nucleatum,F.nucleatum)、中间普雷沃氏菌(Prevotella intermedia,P.intermedia)、丙酸杆菌(Propionibacterium propionicum,P.propionicum)为COA-PWY的主要贡献菌种。其中，T.forsythia是红色复合体的重要成员，其相对丰度最高。唾液及龈下菌斑中贡献菌和序列的相对丰度具有统计学差异(P<0.05)。3 讨论

【参考文献】：
期刊论文
[1]抑郁症患者肠道菌群丰度和种类及基因功能通路的病例对照研究[J]. 荣晗,徐丹,刘铁榜,王明帮,赵杰,刘泱慧,杨海晨,张建.  中华精神科杂志. 2017 (03)
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本文编号：3441164