成釉细胞瘤患者lncRNA-mRNA共表达网络分析及作用研究

发布时间：2021-11-07 20:55

　　目的:分析成釉细胞瘤患者与正常人群基因表达谱芯片差异表达的基因和长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）,探讨关键lncRNA及其参与的信号通路。材料与方法:在公共数据库基因表达数据库（gene expression omnibus,GEO）中下载成釉细胞瘤相关芯片数据集GES38494及GES132472,筛选差异表达的基因及lncRNA,构建lncRNA-m RNA共表达网络并分析其参与的GO及KEGG通路,STRING数据库进行蛋白质相互作用分析并筛选核心基因。结果:经差异分析共筛选出801个差异表达基因,其中差异表达的lnc RNA6个,与283个m RNA存在共表达关系。lncRNA-m RNA共表达网络中的m RNA主要参与上皮发育、皮肤发育、表皮细胞分化、角化细胞分化、角化作用等生物学功能和干细胞多能性调节通路、胰腺分泌、视黄醇代谢、轴突导向、细胞外基质-受体相互作用、黏着班等KEGG信号通路。蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）分析中IVL是连接度最大的核心基因,与其共表达的lnc RN... 

【文章来源】：2020年中华口腔医学会口腔生物医学专业委员会第十次全国口腔生物医学学术年会暨第六次全国口腔杰青优青论坛论文汇编中华口腔医学会会议论文集

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本文编号：3482393